6QZH_refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Inactive

VERSION

2020-10-08

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

NGL is a WebGL based 3D viewer powered by MMTF.

MAIN TEMPLATE

CCR7 (sequence similarity: 100%) PDB: 6QZH

TEMPLATES

5LWE (CCR9)
6QZH (CCR7)
6LFO (CXCR2)
6LFL (CXCR2)
6WWZ (CCR6)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 81.2 13.4 5.4
Side-chains 76.8 13.1 10.1

Number of backbone templates: 5
Number of rotamer templates: 21

Segment Seq.num. AA GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 50 K - - - -
N-term 51 K - - - -
N-term 52 D - - - -
N-term 53 V - - - -
N-term 54 R - - - -
TM1 55 N 1.29x29 CCR9 5LWE CXCR4 3ODU
TM1 56 F 1.30x30 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 57 K 1.31x31 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 58 A 1.32x32 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 59 W 1.33x33 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 60 F 1.34x34 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 61 L 1.35x35 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 62 P 1.36x36 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 63 I 1.37x37 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 64 M 1.38x38 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 65 Y 1.39x39 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 66 S 1.40x40 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 67 I 1.41x41 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 68 I 1.42x42 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 69 C 1.43x43 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 70 F 1.44x44 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 71 V 1.45x45 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 72 G 1.46x46 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 73 L 1.47x47 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 74 L 1.48x48 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 75 G 1.49x49 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 76 N 1.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 77 G 1.51x51 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 78 L 1.52x52 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 79 V 1.53x53 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 80 V 1.54x54 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 81 L 1.55x55 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 82 T 1.56x56 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 83 Y 1.57x57 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 84 I 1.58x58 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 85 Y 1.59x59 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM1 86 F 1.60x60 CCR9 5LWE - -
ICL1 87 K 12.48x48 CCR7 6QZH M3 receptor 5ZHP
ICL1 88 R 12.49x49 CCR7 6QZH NK1 receptor 6HLP
ICL1 89 L 12.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ICL1 90 K 12.51x51 CCR7 6QZH μ receptor 4DKL
TM2 91 T 2.37x37 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 92 M 2.38x38 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 93 T 2.39x39 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 94 D 2.40x40 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 95 T 2.41x41 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 96 Y 2.42x42 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 97 L 2.43x43 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 98 L 2.44x44 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 99 N 2.45x45 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 100 L 2.46x46 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 101 A 2.47x47 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 102 V 2.48x48 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 103 A 2.49x49 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 104 D 2.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 105 I 2.51x51 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 106 L 2.52x52 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 107 F 2.53x53 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 108 L 2.54x54 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 109 L 2.55x55 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 110 T 2.56x56 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 111 L 2.57x57 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 112 P 2.58x58 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 113 F 2.59x59 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 114 W 2.60x60 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 115 A 2.61x61 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 116 Y 2.62x62 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 117 S 2.63x63 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 118 A 2.64x64 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 119 A 2.65x65 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM2 120 K 2.66x66 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL1 121 S 23.49x49 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL1 122 W 23.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL1 123 V 23.51x51 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL1 124 F 23.52x52 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 125 G 3.21x21 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 126 V 3.22x22 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 127 H 3.23x23 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 128 F 3.24x24 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 129 C 3.25x25 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 130 K 3.26x26 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 131 L 3.27x27 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 132 I 3.28x28 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 133 F 3.29x29 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 134 A 3.30x30 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 135 I 3.31x31 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 136 Y 3.32x32 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 137 K 3.33x33 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 138 M 3.34x34 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 139 S 3.35x35 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 140 F 3.36x36 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 141 F 3.37x37 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 142 S 3.38x38 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 143 G 3.39x39 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 144 M 3.40x40 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 145 L 3.41x41 CCR7 6QZH CCR9 5LWE
TM3 146 L 3.42x42 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 147 L 3.43x43 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 148 L 3.44x44 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 149 C 3.45x45 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 150 I 3.46x46 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 151 S 3.47x47 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 152 I 3.48x48 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 153 D 3.49x49 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 154 R 3.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 155 Y 3.51x51 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 156 V 3.52x52 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 157 A 3.53x53 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 158 I 3.54x54 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 159 V 3.55x55 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM3 160 Q 3.56x56 CCR9 5LWE CCR9 5LWE
ICL2 161 A 34.50x50 - - - -
ICL2 162 V 34.51x51 CXCR2 6LFO CCR2 5T1A
ICL2 163 S 34.52x52 CXCR2 6LFO M1 receptor 6WJC
ICL2 164 A 34.53x53 CXCR2 6LFO CCR9 5LWE
ICL2 165 H 34.54x54 CXCR2 6LFO CCR9 5LWE
ICL2 166 R 34.55x55 CXCR2 6LFO C5a1 receptor 5O9H
ICL2 167 H 34.56x56 CXCR2 6LFO DP2 receptor 6D27
ICL2 168 R 34.57x57 CXCR2 6LFO CCR5 5UIW
ICL2 169 A 34.58x58 CXCR2 6LFO - -
ICL2 170 R CXCR2 6LFO - -
TM4 171 V 4.38x38 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 172 L 4.39x39 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 173 L 4.40x40 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 174 I 4.41x41 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 175 S 4.42x42 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 176 K 4.43x43 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 177 L 4.44x44 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 178 S 4.45x45 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 179 C 4.46x46 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 180 V 4.47x47 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 181 G 4.48x48 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 182 I 4.49x49 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 183 W 4.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 184 I 4.51x51 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 185 L 4.52x52 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 186 A 4.53x53 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 187 T 4.54x54 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 188 V 4.55x55 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 189 L 4.56x56 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 190 S 4.57x57 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 191 I 4.58x59 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 192 P 4.59x60 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 193 E 4.60x61 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 194 L 4.61x62 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 195 L 4.62x63 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 196 Y 4.63x64 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM4 197 S 4.64x65 CXCR2 6LFL NK1 receptor 6HLP
ECL2 198 D CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 199 L CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 200 Q CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 201 R CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 202 S CCR7 6QZH - -
ECL2 203 S CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 204 S CCR7 6QZH - -
ECL2 205 E CCR7 6QZH - -
ECL2 206 Q CCR7 6QZH - -
ECL2 207 A CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 208 M CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 209 R CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 210 C 45.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 211 S 45.51x51 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 212 L 45.52x52 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 213 I CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 214 T CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 215 E CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 216 H CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL2 217 V CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 218 E 5.33x34 CCR6 6WWZ - -
TM5 219 A 5.34x35 CCR6 6WWZ OX2 receptor 6TPN
TM5 220 F 5.35x36 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 221 I 5.36x37 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 222 T 5.37x38 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 223 I 5.38x39 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 224 Q 5.39x40 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 225 V 5.40x41 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 226 A 5.41x42 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 227 Q 5.42x43 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 228 M 5.43x44 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 229 V 5.44x45 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 230 I 5.45x46 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 231 G 5.46x461 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 232 F 5.47x47 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 233 L 5.48x48 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 234 V 5.49x49 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 235 P 5.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 236 L 5.51x51 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 237 L 5.52x52 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 238 A 5.53x53 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 239 M 5.54x54 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 240 S 5.55x55 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 241 F 5.56x56 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 242 C 5.57x57 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 243 Y 5.58x58 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 244 L 5.59x59 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 245 V 5.60x60 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 246 I 5.61x61 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 247 I 5.62x62 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM5 248 R 5.63x63 CCR6 6WWZ CXCR2 6LFL
TM5 249 T 5.64x64 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 250 L 5.65x65 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 251 L 5.66x66 CCR6 6WWZ CCR5 5UIW
TM5 252 Q 5.67x67 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
TM5 253 A 5.68x68 CCR6 6WWZ CCR6 6WWZ
ICL3 254 R - - - -
ICL3 255 N - - - -
TM6 256 F 6.28x28 CCR9 5LWE - -
TM6 257 E 6.29x29 CCR9 5LWE Y1 receptor 5ZBH
TM6 258 R 6.30x30 CCR9 5LWE CCR5 5UIW
TM6 259 N 6.31x31 CCR9 5LWE - -
TM6 260 K 6.32x32 CCR9 5LWE CCR9 5LWE
TM6 261 A 6.33x33 CCR9 5LWE CCR9 5LWE
TM6 262 I 6.34x34 CCR9 5LWE CCR6 6WWZ
TM6 263 K 6.35x35 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 264 V 6.36x36 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 265 I 6.37x37 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 266 I 6.38x38 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 267 A 6.39x39 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 268 V 6.40x40 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 269 V 6.41x41 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 270 V 6.42x42 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 271 V 6.43x43 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 272 F 6.44x44 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 273 I 6.45x45 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 274 V 6.46x46 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 275 F 6.47x47 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 276 Q 6.48x48 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 277 L 6.49x49 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 278 P 6.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 279 Y 6.51x51 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 280 N 6.52x52 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 281 G 6.53x53 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 282 V 6.54x54 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 283 V 6.55x55 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 284 L 6.56x56 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 285 A 6.57x57 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 286 Q 6.58x58 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM6 287 T 6.59x59 CCR9 5LWE CCR9 5LWE
TM6 288 V 6.60x60 CCR9 5LWE OX2 receptor 5WS3
TM6 289 A 6.61x61 CCR9 5LWE P2Y1 receptor 4XNW
TM6 290 N 6.62x62 CCR9 5LWE - -
TM6 291 F 6.63x63 CCR9 5LWE CCR5 6AKX
TM6 292 N 6.64x64 CCR9 5LWE - -
TM6 293 I 6.65x65 CCR9 5LWE - -
ECL3 294 T - - - -
ECL3 295 S - - - -
ECL3 296 S - - - -
TM7 297 T 7.24x23 CCR9 5LWE NTS1 receptor 4BUO
TM7 298 C 7.25x24 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 299 E 7.26x25 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 300 L 7.27x26 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 301 S 7.28x27 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 302 K 7.29x28 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 303 Q 7.30x29 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 304 L 7.31x30 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 305 N 7.32x31 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 306 I 7.33x32 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 307 A 7.34x33 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 308 Y 7.35x34 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 309 D 7.36x35 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 310 V 7.37x36 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 311 T 7.38x37 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 312 Y 7.39x38 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 313 S 7.40x39 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 314 L 7.41x40 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 315 A 7.42x41 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 316 C 7.43x42 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 317 V 7.44x43 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 318 R 7.45x45 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 319 C 7.46x46 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 320 C 7.47x47 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 321 V 7.48x48 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 322 N 7.49x49 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 323 P 7.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 324 F 7.51x51 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 325 L 7.52x52 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 326 Y 7.53x53 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 327 A 7.54x54 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 328 F 7.55x55 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
TM7 329 I 7.56x56 CCR9 5LWE CXCR2 6LFL
H8 330 G 8.47x47 CCR9 5LWE CCR9 5LWE
H8 331 V 8.48x48 CCR9 5LWE - -
H8 332 K 8.49x49 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
H8 333 F 8.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
H8 334 R 8.51x51 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
H8 335 N 8.52x52 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
H8 336 D 8.53x53 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
H8 337 L 8.54x54 CCR7 6QZH CCR9 5LWE
H8 338 F 8.55x55 CCR7 6QZH succinate receptor 6RNK
H8 339 K 8.56x56 CCR7 6QZH CCR9 5LWE
H8 340 L 8.57x57 CCR7 6QZH δ receptor 4N6H
H8 341 F 8.58x58 CCR7 6QZH CCR5 5UIW
H8 342 K 8.59x59 CCR9 5LWE CCR9 5LWE
C-term 343 D - - - -
C-term 344 L - - - -
C-term 345 G - - - -
C-term 346 C - - - -
C-term 347 L - - - -