6OIJ_refined

PROTEIN CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

STATE

Active (Δ distance (Å): 9.5 docs)

VERSION

2020-07-30

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 100%) PDB: 6OIJ

TEMPLATES

5CXV (M1 receptor)
6OIJ (M1 receptor)
6OL9 (M5 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 87.9 4.9 7.2
Side-chains 82.6 8.2 9.2

Number of backbone templates: 3
Number of rotamer templates: 11

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 17 - - - -
N-term 18 - - - -
N-term 19 - - - -
N-term 20 - - - -
N-term 21 - - - -
TM1 22 1.29x29 M1 receptor 5CXV M1 receptor 5CXV
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TM1 29 1.36x36 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM1 40 1.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 41 1.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM2 68 2.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM2 85 2.64x63 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 86 2.65x64 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM2 88 2.67x66 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 89 2.68x67 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ECL1 91 23.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM3 123 3.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ICL2 135 34.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ECL2 172 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 173 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ECL2 175 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ECL2 177 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ECL2 180 45.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 181 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 182 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM5 220 5.70x70 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 221 5.71x71 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ICL3 226 - - - -
ICL3 227 - - - -
ICL3 228 - - - -
ICL3 229 - - - -
ICL3 230 - - - -
ICL3 349 - - - -
ICL3 350 - - - -
ICL3 351 - - - -
ICL3 352 - - - -
ICL3 353 - - - -
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TM6 374 6.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 375 6.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 376 6.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM6 380 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 381 6.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 382 6.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 383 6.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 384 6.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM6 387 6.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ECL3 392 - - - -
ECL3 393 M1 receptor 5CXV - -
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ECL3 395 - - - -
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TM7 404 7.39x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM7 413 7.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 414 7.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 415 7.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 416 7.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 417 7.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 418 7.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 419 7.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 420 7.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 421 7.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 422 8.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 423 8.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 424 8.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 425 8.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 426 8.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 427 8.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
H8 428 8.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 429 8.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 430 8.55x55 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 4UHR
H8 431 8.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 432 8.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 433 8.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 434 8.59x59 M1 receptor 5CXV M1 receptor 5CXV
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