XCR1 - G(z) subunit alpha complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAZ

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 45%) PDB: 6OMM
G(i) subunit alpha-1 (sequence similarity: 79%)

RECEPTOR TEMPLATES

5UIW (CCR5)
4MBS (CCR5)
6OMM (FPR2/ALX)
4ZUD (AT1 receptor)
4EJ4 (δ receptor)
3ODU (CXCR4)
3VW7 (PAR1)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 80.4 12.4 7.2
Side-chains 23.0 61.9 15.1

Number of backbone templates: 7
Number of rotamer templates: 49

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 18 - CCR5 5UIW CCR5 5UIW
N-term 19 - CCR5 5UIW CCR5 5UIW
N-term 20 - CCR5 5UIW CCR5 5UIW
N-term 21 - CCR5 5UIW CCR5 5UIW
N-term 22 - CCR5 5UIW CCR5 5UIW
TM1 23 1.24x24 CCR5 5UIW - -
TM1 24 1.25x25 CCR5 5UIW - -
TM1 25 1.26x26 CCR5 5UIW β2-adrenoceptor 3P0G
TM1 26 1.27x27 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 27 1.28x28 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 28 1.29x29 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 29 1.30x30 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQS
TM1 30 1.31x31 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM1 31 1.32x32 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM1 32 1.33x33 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 5XRA
TM1 33 1.34x34 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 34 1.35x35 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 35 1.36x36 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 36 1.37x37 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 37 1.38x38 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 38 1.39x39 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 39 1.40x40 FPR2/ALX 6OMM ETB receptor 5X93
TM1 40 1.41x41 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 41 1.42x42 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 42 1.43x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 43 1.44x44 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 44 1.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 45 1.46x46 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM1 46 1.47x47 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 47 1.48x48 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 48 1.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 49 1.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 50 1.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 51 1.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 52 1.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 53 1.54x54 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 5DYS
TM1 54 1.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 55 1.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 56 1.57x57 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6UP7
TM1 57 1.58x58 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM1 58 1.59x59 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 59 1.60x60 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
ICL1 60 12.48x48 - - - -
ICL1 61 12.49x49 AT1 receptor 4ZUD CB1 receptor 5TGZ
ICL1 62 12.50x50 AT1 receptor 4ZUD AT1 receptor 4ZUD
ICL1 63 12.51x51 - - - -
TM2 64 2.37x37 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM2 65 2.38x38 FPR2/ALX 6OMM CCR2 5T1A
TM2 66 2.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 67 2.40x40 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 68 2.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 69 2.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 70 2.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 71 2.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 72 2.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 73 2.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 74 2.47x47 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 75 2.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 76 2.49x49 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 77 2.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 78 2.51x51 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 79 2.52x52 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 80 2.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 81 2.54x54 FPR2/ALX 6OMM NK1 receptor 6HLP
TM2 82 2.55x55 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 83 2.56x56 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 84 2.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 85 2.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 86 2.59x59 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM2 87 2.60x60 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 88 2.61x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 89 2.62x62 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM2 90 2.63x63 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 91 2.64x64 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 92 2.65x65 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM2 93 2.66x66 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
ECL1 94 23.49x49 - - - -
ECL1 95 23.50x50 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
ECL1 96 23.51x51 CCR5 5UIW Rhodopsin 5DYS
ECL1 97 23.52x52 - - - -
TM3 98 3.21x21 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 99 3.22x22 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 100 3.23x23 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 101 3.24x24 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 102 3.25x25 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 103 3.26x26 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 104 3.27x27 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 105 3.28x28 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 106 3.29x29 FPR2/ALX 6OMM CCR9 5LWE
TM3 107 3.30x30 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 108 3.31x31 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 109 3.32x32 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 110 3.33x33 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 111 3.34x34 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 112 3.35x35 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM3 113 3.36x36 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 114 3.37x37 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 115 3.38x38 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM3 116 3.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 117 3.40x40 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 118 3.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 119 3.42x42 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 120 3.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 121 3.44x44 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 122 3.45x45 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM3 123 3.46x46 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 124 3.47x47 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM3 125 3.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 126 3.49x49 FPR2/ALX 6OMM P2Y1 receptor 4XNW
TM3 127 3.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 128 3.51x51 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 129 3.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 130 3.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 131 3.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 132 3.55x55 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 133 3.56x56 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
ICL2 134 34.50x50 - - - -
ICL2 135 34.51x51 CCR5 5UIW M1 receptor 6OIJ
ICL2 136 34.52x52 CCR5 5UIW M1 receptor 6OIJ
ICL2 137 34.53x53 CCR5 5UIW - -
ICL2 138 34.54x54 CCR5 5UIW κ receptor 6B73
ICL2 139 34.55x55 CCR5 5UIW Rhodopsin 4ZWJ
ICL2 140 34.56x56 CCR5 5UIW A1 receptor 6D9H
ICL2 141 34.57x57 - - - -
TM4 142 4.38x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 143 4.39x39 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM4 144 4.40x40 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM4 145 4.41x41 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 146 4.42x42 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 147 4.43x43 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM4 148 4.44x44 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM4 149 4.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 150 4.46x46 FPR2/ALX 6OMM apelin receptor 5VBL
TM4 151 4.47x47 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 152 4.48x48 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 153 4.49x49 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 154 4.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 155 4.51x51 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 156 4.52x52 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM4 157 4.53x53 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM4 158 4.54x54 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2C receptor 6BQG
TM4 159 4.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 160 4.56x56 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 161 4.57x57 δ receptor 4EJ4 AT1 receptor 6OS2
TM4 162 4.58x58 δ receptor 4EJ4 κ receptor 6B73
TM4 163 4.59x59 δ receptor 4EJ4 δ receptor 4EJ4
TM4 164 4.60x60 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 165 4.61x61 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 166 4.62x62 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 167 4.63x63 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM4 168 4.64x64 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
ECL2 169 - - - - -
ECL2 170 - - - - -
ECL2 171 - - - - -
ECL2 172 - - - - -
ECL2 173 - - - - -
ECL2 174 - - - - -
ECL2 175 45.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 176 45.51x51 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3ODU
ECL2 177 45.52x52 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
ECL2 178 - - - - -
ECL2 179 - CXCR4 3ODU - -
ECL2 180 - CXCR4 3ODU - -
ECL2 181 - - - - -
TM5 182 5.35x35 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 183 5.36x36 FPR2/ALX 6OMM P2Y1 receptor 4XNW
TM5 184 5.37x37 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 185 5.38x38 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 5XRA
TM5 186 5.39x39 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 187 5.40x40 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 188 5.41x41 FPR2/ALX 6OMM CysLT1 receptor 6RZ4
TM5 189 5.42x42 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3ODU
TM5 190 5.43x43 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3ODU
TM5 191 5.44x44 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 192 5.45x45 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM5 193 5.46x46 PAR1 3VW7 PAR1 3VW7
TM5 194 5.47x47 PAR1 3VW7 PAR1 3VW7
TM5 195 5.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 196 5.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 197 5.50x50 FPR2/ALX 6OMM TP receptor 6IIV
TM5 198 5.51x51 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM5 199 5.52x52 FPR2/ALX 6OMM OX1 receptor 6TO7
TM5 200 5.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 201 5.54x54 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM5 202 5.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 203 5.56x56 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 204 5.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 205 5.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 206 5.59x59 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM5 207 5.60x60 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM5 208 5.61x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 209 5.62x62 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 210 5.63x63 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM5 211 5.64x64 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 212 5.65x65 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 213 5.66x66 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 214 5.67x67 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 215 5.68x68 FPR2/ALX 6OMM P2Y12 receptor 4NTJ
ICL3 216 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 217 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 218 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ICL3 219 - FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 220 6.30x30 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
TM6 221 6.31x31 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 4LDE
TM6 222 6.32x32 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 223 6.33x33 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM6 224 6.34x34 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 225 6.35x35 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 226 6.36x36 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 227 6.37x37 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 228 6.38x38 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM6 229 6.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 230 6.40x40 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 231 6.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 232 6.42x42 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 233 6.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 234 6.44x44 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM6 235 6.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 236 6.46x46 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 237 6.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 238 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 239 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM6 240 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 241 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 242 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 243 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM P2Y12 receptor 4NTJ
TM6 244 6.54x54 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 245 6.55x55 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 246 6.56x56 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 247 6.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 248 6.58x58 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM6 249 6.59x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 250 6.60x60 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 251 6.61x61 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM6 252 6.62x62 CCR5 4MBS succinate receptor 6RNK
TM6 253 6.63x63 CCR5 4MBS LPA6 receptor 5XSZ
TM6 254 6.64x64 CCR5 4MBS - -
ECL3 255 - - - - -
ECL3 256 - AT1 receptor 4ZUD AT1 receptor 4ZUD
ECL3 257 - - - - -
TM7 258 7.24x23 CCR5 5UIW US28 5WB1
TM7 259 7.25x24 CCR5 5UIW CCR5 5UIW
TM7 260 7.26x25 CCR5 5UIW US28 5WB1
TM7 261 7.27x26 CCR5 5UIW LPA6 receptor 5XSZ
TM7 262 7.28x27 CCR5 5UIW CysLT2 receptor 6RZ6
TM7 263 7.29x28 FPR2/ALX 6OMM PAF receptor 5ZKQ
TM7 264 7.30x29 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM7 265 7.31x30 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM7 266 7.32x31 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2C receptor 6BQG
TM7 267 7.33x32 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM7 268 7.34x33 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM7 269 7.35x34 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM7 270 7.36x35 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM7 271 7.37x36 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM7 272 7.38x37 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM7 273 7.39x38 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM7 274 7.40x39 FPR2/ALX 6OMM ETB receptor 5X93
TM7 275 7.41x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 276 7.42x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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G-PROTEIN TEMPLATES

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