TAAR6 - subunit alpha-14 complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNA14

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 47%) PDB: 6OIJ
subunit alpha-11 (sequence similarity: 91%)

RECEPTOR TEMPLATES

4IAQ (5-HT1B receptor)
6OIJ (M1 receptor)
4UHR (A2A receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 77.6 10.4 12.0
Side-chains 24.6 53.6 21.8

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 43

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 23 - 5-HT1B receptor 4IAQ 5-HT1B receptor 4IAQ
N-term 24 - 5-HT1B receptor 4IAQ 5-HT1B receptor 4IAQ
N-term 25 - 5-HT1B receptor 4IAQ 5-HT1B receptor 4IAQ
N-term 26 - 5-HT1B receptor 4IAQ 5-HT1B receptor 4IAQ
N-term 27 - 5-HT1B receptor 4IAQ 5-HT1B receptor 4IAQ
TM1 28 1.28x28 5-HT1B receptor 4IAQ 5-HT1B receptor 4IAQ
TM1 29 1.29x29 5-HT1B receptor 4IAQ Rhodopsin 4ZWJ
TM1 30 1.30x30 M1 receptor 6OIJ D4 receptor 5WIV
TM1 31 1.31x31 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6PWC
TM1 32 1.32x32 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM1 33 1.33x33 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 34 1.34x34 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM1 35 1.35x35 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 36 1.36x36 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 37 1.37x37 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 38 1.38x38 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 39 1.39x39 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM1 40 1.40x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 41 1.41x41 M1 receptor 6OIJ M3 receptor 5ZHP
TM1 42 1.42x42 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 43 1.43x43 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 44 1.44x44 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 45 1.45x45 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 46 1.46x46 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 47 1.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 48 1.48x48 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 49 1.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 50 1.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 51 1.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 52 1.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 53 1.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 54 1.54x54 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM1 55 1.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 56 1.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 57 1.57x57 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 58 1.58x58 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM1 59 1.59x59 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM1 60 1.60x60 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
ICL1 61 12.48x48 - - - -
ICL1 62 12.49x49 5-HT1B receptor 4IAQ CB2 receptor 6KPF
ICL1 63 12.50x50 5-HT1B receptor 4IAQ 5-HT1B receptor 4IAQ
ICL1 64 12.51x51 - - - -
TM2 65 2.37x37 5-HT1B receptor 4IAQ CXCR4 3ODU
TM2 66 2.38x38 5-HT1B receptor 4IAQ 5-HT1B receptor 4IAQ
TM2 67 2.39x39 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 68 2.40x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 69 2.41x41 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 70 2.42x42 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 71 2.43x43 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM2 72 2.44x44 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 73 2.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 74 2.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 75 2.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 76 2.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 77 2.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 78 2.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 79 2.51x51 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM2 80 2.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 81 2.53x53 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 82 2.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 83 2.55x55 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM2 84 2.56x551 M1 receptor 6OIJ OX2 receptor 5WS3
TM2 85 2.57x56 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 86 2.58x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 87 2.59x58 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 88 2.60x59 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 89 2.61x60 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 90 2.62x61 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM2 91 2.63x62 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM2 92 2.64x63 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 93 2.65x64 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 94 2.66x65 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 95 2.67x66 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 96 2.68x67 M1 receptor 6OIJ FFA1 receptor 5TZR
ECL1 97 23.49x49 - - - -
ECL1 98 23.50x50 5-HT1B receptor 4IAQ 5-HT1B receptor 4IAQ
ECL1 99 23.51x51 5-HT1B receptor 4IAQ CXCR4 3ODU
ECL1 100 23.52x52 - - - -
TM3 101 3.21x21 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 102 3.22x22 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM3 103 3.23x23 M1 receptor 6OIJ OX2 receptor 5WS3
TM3 104 3.24x24 M1 receptor 6OIJ apelin receptor 5VBL
TM3 105 3.25x25 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 106 3.26x26 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM3 107 3.27x27 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM3 108 3.28x28 M1 receptor 6OIJ NK1 receptor 6HLP
TM3 109 3.29x29 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 110 3.30x30 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 111 3.31x31 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM3 112 3.32x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 113 3.33x33 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 114 3.34x34 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM3 115 3.35x35 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM3 116 3.36x36 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM3 117 3.37x37 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM3 118 3.38x38 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 119 3.39x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 120 3.40x40 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM3 121 3.41x41 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 122 3.42x42 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM3 123 3.43x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 124 3.44x44 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM3 125 3.45x45 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM3 126 3.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 127 3.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 128 3.48x48 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 129 3.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 130 3.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 131 3.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 132 3.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 133 3.53x53 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM3 134 3.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 135 3.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 136 3.56x56 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 4IAQ
ICL2 137 34.50x50 - - - -
ICL2 138 34.51x51 5-HT1B receptor 4IAQ M2 receptor 4MQT
ICL2 139 34.52x52 5-HT1B receptor 4IAQ - -
ICL2 140 34.53x53 5-HT1B receptor 4IAQ 5-HT1B receptor 4IAQ
ICL2 141 34.54x54 5-HT1B receptor 4IAQ M2 receptor 4MQT
ICL2 142 34.55x55 5-HT1B receptor 4IAQ NTS1 receptor 6PWC
ICL2 143 34.56x56 5-HT1B receptor 4IAQ 5-HT1B receptor 6G79
ICL2 144 34.57x57 - - - -
TM4 145 4.38x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 146 4.39x39 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM4 147 4.40x40 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6PWC
TM4 148 4.41x41 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM4 149 4.42x42 M1 receptor 6OIJ MT1 receptor 6ME3
TM4 150 4.43x43 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM4 151 4.44x44 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 152 4.45x45 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM4 153 4.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 154 4.47x47 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6PWC
TM4 155 4.48x48 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 156 4.49x49 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 157 4.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 158 4.51x51 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 159 4.52x52 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM4 160 4.53x53 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 161 4.54x54 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM4 162 4.55x55 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 163 4.56x56 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 164 4.57x57 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM4 165 4.58x58 M1 receptor 6OIJ S1P1 receptor 3V2Y
TM4 166 4.59x59 M1 receptor 6OIJ D4 receptor 5WIV
TM4 167 4.60x60 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM4 168 4.61x61 M1 receptor 6OIJ Y1 receptor 5ZBH
TM4 169 4.62x62 M1 receptor 6OIJ PAR2 5NDD
TM4 170 4.63x63 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
ECL2 171 - - - - -
ECL2 172 - - - - -
ECL2 173 - - - - -
ECL2 174 - - - - -
ECL2 175 - - - - -
ECL2 176 - - - - -
ECL2 177 - - - - -
ECL2 178 - - - - -
ECL2 179 - - - - -
ECL2 180 - - - - -
ECL2 181 - - - - -
ECL2 182 - - - - -
ECL2 183 - - - - -
ECL2 184 - - - - -
ECL2 185 - - - - -
ECL2 186 - - - - -
ECL2 187 - - - - -
ECL2 188 - - - - -
ECL2 189 - - - - -
ECL2 190 45.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 191 45.51x51 M1 receptor 6OIJ M5 receptor 6OL9
ECL2 192 45.52x52 M1 receptor 6OIJ US28 4XT1
ECL2 193 - - - - -
TM5 194 5.35x36 M1 receptor 6OIJ H1 receptor 3RZE
TM5 195 5.36x37 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM5 196 5.37x38 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 197 5.38x39 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 198 5.39x40 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 199 5.40x41 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 200 5.41x42 M1 receptor 6OIJ Y1 receptor 5ZBH
TM5 201 5.42x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 202 5.43x44 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 203 5.44x45 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 204 5.45x46 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 205 5.46x461 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 206 5.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 207 5.48x48 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 208 5.49x49 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 209 5.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 210 5.51x51 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 211 5.52x52 M1 receptor 6OIJ PAR2 5NDD
TM5 212 5.53x53 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 213 5.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 214 5.55x55 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 215 5.56x56 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 216 5.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 217 5.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 218 5.59x59 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 219 5.60x60 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 220 5.61x61 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 221 5.62x62 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 222 5.63x63 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM5 223 5.64x64 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 224 5.65x65 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 225 5.66x66 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 226 5.67x67 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 227 5.68x68 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 228 5.69x69 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 229 5.70x70 M1 receptor 6OIJ D2 receptor 6LUQ
TM5 230 5.71x71 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 231 5.72x72 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 232 5.73x73 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 4UHR
TM5 233 5.74x74 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI3
ICL3 234 - - - - -
ICL3 235 - - - - -
ICL3 236 - - - - -
ICL3 237 - - - - -
ICL3 238 - - - - -
ICL3 239 - - - - -
ICL3 240 - - - - -
ICL3 241 - - - - -
ICL3 242 - - - - -
ICL3 243 - - - - -
TM6 244 6.21x21 A2A receptor 4UHR - -
TM6 245 6.22x22 A2A receptor 4UHR - -
TM6 246 6.23x23 A2A receptor 4UHR - -
TM6 247 6.24x24 A2A receptor 4UHR Rhodopsin 4ZWJ
TM6 248 6.25x25 A2A receptor 4UHR LPA1 receptor 4Z35
TM6 249 6.26x26 A2A receptor 4UHR M5 receptor 6OL9
TM6 250 6.27x27 A2A receptor 4UHR 5-HT1B receptor 6G79
TM6 251 6.28x28 A2A receptor 4UHR μ receptor 6DDF
TM6 252 6.29x29 A2A receptor 4UHR 5-HT1B receptor 6G79
TM6 253 6.30x30 A2A receptor 4UHR A2A receptor 4UHR
TM6 254 6.31x31 A2A receptor 4UHR 5-HT2C receptor 6BQG
TM6 255 6.32x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 256 6.33x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 257 6.34x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 258 6.35x35 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM6 259 6.36x36 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 260 6.37x37 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 261 6.38x38 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM6 262 6.39x39 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM6 263 6.40x40 M1 receptor 6OIJ PAR2 5NDD
TM6 264 6.41x41 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM6 265 6.42x42 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM6 266 6.43x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 267 6.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 268 6.45x45 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 269 6.46x46 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM6 270 6.47x47 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 271 6.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 272 6.49x49 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM6 273 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 274 6.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 275 6.52x52 M1 receptor 6OIJ OX2 receptor 5WS3
TM6 276 6.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 277 6.54x54 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 278 6.55x55 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM6 279 6.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 280 6.57x57 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM6 281 6.58x58 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM6 282 6.59x59 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM6 283 6.60x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 284 6.61x61 M1 receptor 6OIJ - -
ECL3 285 - - - - -
ECL3 286 - β2-adrenoceptor 3SN6 - -
ECL3 287 - β2-adrenoceptor 3SN6 - -
ECL3 288 - - - - -
TM7 289 7.31x30 5-HT1B receptor 4IAQ M2 receptor 4MQT
TM7 290 7.32x31 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 291 7.33x32 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM7 292 7.34x33 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM7 293 7.35x34 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM7 294 7.36x35 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM7 295 7.37x36 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM7 296 7.38x37 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM7 297 7.39x38 M1 receptor 6OIJ - -
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TM7 299 7.41x40 M1 receptor 6OIJ - -
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G-PROTEIN TEMPLATES

Segment Seq.num. CGN# Backbone PDB Rotamer PDB
HN 8 G.HN.30 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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