TAAR2 - subunit alpha-11 complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNA11

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 42%) PDB: 6OIJ
subunit alpha-11 (sequence similarity: 100%)

RECEPTOR TEMPLATES

3P0G (β2-adrenoceptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
2RH1 (β2-adrenoceptor)
6OIJ (M1 receptor)
6CM4 (D2 receptor)
4UHR (A2A receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 75.8 15.7 8.5
Side-chains 18.0 60.1 21.9

Number of backbone templates: 6
Number of rotamer templates: 50

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 31 - - - - -
N-term 32 - - - - -
N-term 33 - - - - -
N-term 34 - - - - -
N-term 35 - - - - -
TM1 36 1.25x25 β2-adrenoceptor 3P0G - -
TM1 37 1.26x26 β2-adrenoceptor 3P0G CXCR4 4RWS
TM1 38 1.27x27 β2-adrenoceptor 3P0G β2-adrenoceptor 3P0G
TM1 39 1.28x28 β2-adrenoceptor 3P0G δ receptor 4EJ4
TM1 40 1.29x29 β2-adrenoceptor 3P0G 5-HT1B receptor 6G79
TM1 41 1.30x30 M1 receptor 6OIJ D4 receptor 5WIV
TM1 42 1.31x31 M1 receptor 6OIJ MT2 receptor 6ME6
TM1 43 1.32x32 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM1 44 1.33x33 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 45 1.34x34 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 46 1.35x35 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 47 1.36x36 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 48 1.37x37 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM1 49 1.38x38 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM1 50 1.39x39 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 51 1.40x40 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 52 1.41x41 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM1 53 1.42x42 M1 receptor 6OIJ BLT1 receptor 5X33
TM1 54 1.43x43 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 55 1.44x44 M1 receptor 6OIJ CCR7 6QZH
TM1 56 1.45x45 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM1 57 1.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 58 1.47x47 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 59 1.48x48 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 60 1.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 61 1.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 62 1.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 63 1.52x52 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM1 64 1.53x53 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 65 1.54x54 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 66 1.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 67 1.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 68 1.57x57 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 69 1.58x58 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 70 1.59x59 M1 receptor 6OIJ CXCR4 3ODU
TM1 71 1.60x60 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
ICL1 72 12.48x48 - - - -
ICL1 73 12.49x49 D2 receptor 6CM4 CB2 receptor 6KPF
ICL1 74 12.50x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ICL1 75 12.51x51 - - - -
TM2 76 2.37x37 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM2 77 2.38x38 D2 receptor 6CM4 5-HT1B receptor 6G79
TM2 78 2.39x39 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 79 2.40x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 80 2.41x41 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 81 2.42x42 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 82 2.43x43 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 83 2.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 84 2.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 85 2.46x46 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM2 86 2.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 87 2.48x48 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM2 88 2.49x49 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 89 2.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 90 2.51x51 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM2 91 2.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 92 2.53x53 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM2 93 2.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 94 2.55x55 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 5DYS
TM2 95 2.56x551 M1 receptor 6OIJ OX2 receptor 5WS3
TM2 96 2.57x56 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM2 97 2.58x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 98 2.59x58 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 99 2.60x59 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM2 100 2.61x60 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 101 2.62x61 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM2 102 2.63x62 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM2 103 2.64x63 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 104 2.65x64 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM2 105 2.66x65 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 106 2.67x66 M1 receptor 6OIJ - -
ECL1 107 - - - - -
ECL1 108 23.49x49 D2 receptor 6CM4 - -
ECL1 109 23.50x50 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
ECL1 110 23.51x51 D2 receptor 6CM4 CXCR4 3ODU
ECL1 111 23.52x52 - - - -
TM3 112 3.21x21 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 113 3.22x22 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 114 3.23x23 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 5DYS
TM3 115 3.24x24 M1 receptor 6OIJ CCR7 6QZH
TM3 116 3.25x25 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 117 3.26x26 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM3 118 3.27x27 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM3 119 3.28x28 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6PWC
TM3 120 3.29x29 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM3 121 3.30x30 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 122 3.31x31 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 123 3.32x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 124 3.33x33 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 125 3.34x34 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM3 126 3.35x35 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 127 3.36x36 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 128 3.37x37 M1 receptor 6OIJ MT1 receptor 6ME2
TM3 129 3.38x38 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM3 130 3.39x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 131 3.40x40 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 132 3.41x41 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM3 133 3.42x42 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM3 134 3.43x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 135 3.44x44 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 136 3.45x45 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6PWC
TM3 137 3.46x46 M1 receptor 6OIJ NK1 receptor 6HLP
TM3 138 3.47x47 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 139 3.48x48 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 140 3.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 141 3.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 142 3.51x51 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM3 143 3.52x52 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM3 144 3.53x53 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 145 3.54x54 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 146 3.55x55 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM3 147 3.56x56 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
ICL2 148 34.50x50 - - - -
ICL2 149 34.51x51 β2-adrenoceptor 3SN6 A2A receptor 5G53
ICL2 150 34.52x52 β2-adrenoceptor 3SN6 OX1 receptor 4ZJ8
ICL2 151 34.53x53 β2-adrenoceptor 3SN6 β2-adrenoceptor 3SN6
ICL2 152 34.54x54 β2-adrenoceptor 3SN6 5-HT1B receptor 4IAQ
ICL2 153 34.55x55 β2-adrenoceptor 3SN6 NTS1 receptor 6PWC
ICL2 154 34.56x56 β2-adrenoceptor 3SN6 5-HT1B receptor 6G79
ICL2 155 34.57x57 - - - -
TM4 156 4.38x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 157 4.39x39 M1 receptor 6OIJ CysLT2 receptor 6RZ6
TM4 158 4.40x40 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM4 159 4.41x41 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM4 160 4.42x42 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 161 4.43x43 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM4 162 4.44x44 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 163 4.45x45 M1 receptor 6OIJ D4 receptor 5WIV
TM4 164 4.46x46 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM4 165 4.47x47 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 166 4.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 167 4.49x49 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM4 168 4.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 169 4.51x51 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 170 4.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 171 4.53x53 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 172 4.54x54 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 173 4.55x55 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM4 174 4.56x56 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM4 175 4.57x57 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 176 4.58x58 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 177 4.59x59 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 178 4.60x60 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM4 179 4.61x61 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 180 4.62x62 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM4 181 4.63x63 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 182 4.64x64 M1 receptor 6OIJ FFA1 receptor 5TZY
ECL2 183 - - - - -
ECL2 184 - β2-adrenoceptor 2RH1 β2-adrenoceptor 2RH1
ECL2 185 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 186 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 187 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 188 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 189 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 190 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 191 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 192 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 193 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 194 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 195 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 196 - β2-adrenoceptor 2RH1 β2-adrenoceptor 2RH1
ECL2 197 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 198 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 199 - β2-adrenoceptor 2RH1 - -
ECL2 200 - - - - -
ECL2 201 45.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 202 45.51x51 M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 203 45.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
ECL2 204 - - - - -
ECL2 205 - - - - -
TM5 206 5.35x36 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 207 5.36x37 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM5 208 5.37x38 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM5 209 5.38x39 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 210 5.39x40 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 211 5.40x41 M1 receptor 6OIJ Y1 receptor 5ZBH
TM5 212 5.41x42 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 213 5.42x43 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM5 214 5.43x44 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM5 215 5.44x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 5CXV
TM5 216 5.45x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 217 5.46x461 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 218 5.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 219 5.48x48 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 220 5.49x49 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 221 5.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 222 5.51x51 M1 receptor 6OIJ CXCR4 3ODU
TM5 223 5.52x52 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM5 224 5.53x53 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 225 5.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 226 5.55x55 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 227 5.56x56 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM5 228 5.57x57 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 229 5.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 230 5.59x59 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 231 5.60x60 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM5 232 5.61x61 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 233 5.62x62 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 234 5.63x63 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM5 235 5.64x64 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 236 5.65x65 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM5 237 5.66x66 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 238 5.67x67 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 239 5.68x68 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 240 5.69x69 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 241 5.70x70 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 4BUO
TM5 242 5.71x71 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM5 243 5.72x72 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 244 5.73x73 M1 receptor 6OIJ - -
ICL3 245 - - - - -
ICL3 246 - - - - -
ICL3 247 - - - - -
ICL3 248 - - - - -
TM6 249 6.22x22 A2A receptor 4UHR - -
TM6 250 6.23x23 A2A receptor 4UHR - -
TM6 251 6.24x24 A2A receptor 4UHR - -
TM6 252 6.25x25 A2A receptor 4UHR - -
TM6 253 6.26x26 A2A receptor 4UHR OX2 receptor 5WS3
TM6 254 6.27x27 A2A receptor 4UHR NTS1 receptor 5T04
TM6 255 6.28x28 A2A receptor 4UHR Rhodopsin 5DYS
TM6 256 6.29x29 A2A receptor 4UHR A2A receptor 4UHR
TM6 257 6.30x30 A2A receptor 4UHR CB1 receptor 5XRA
TM6 258 6.31x31 A2A receptor 4UHR M2 receptor 6OIK
TM6 259 6.32x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 260 6.33x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 261 6.34x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 262 6.35x35 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 263 6.36x36 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 264 6.37x37 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 265 6.38x38 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 266 6.39x39 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 267 6.40x40 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 268 6.41x41 M1 receptor 6OIJ CXCR4 3ODU
TM6 269 6.42x42 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 270 6.43x43 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM6 271 6.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 272 6.45x45 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 273 6.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 274 6.47x47 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 275 6.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 276 6.49x49 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM6 277 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 278 6.51x51 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 279 6.52x52 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 280 6.53x53 M1 receptor 6OIJ MT1 receptor 6ME2
TM6 281 6.54x54 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 282 6.55x55 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM6 283 6.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 284 6.57x57 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM6 285 6.58x58 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM6 286 6.59x59 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 4IAQ
TM6 287 6.60x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 288 6.61x61 M1 receptor 6OIJ ETB receptor 5XPR
ECL3 289 - - - - -
ECL3 290 - D2 receptor 6CM4 - -
ECL3 291 - D2 receptor 6CM4 - -
ECL3 292 - - - - -
TM7 293 7.31x30 D2 receptor 6CM4 D2 receptor 6CM4
TM7 294 7.32x31 M1 receptor 6OIJ M5 receptor 6OL9
TM7 295 7.33x32 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM7 296 7.34x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 297 7.35x34 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM7 298 7.36x35 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 4IAQ
TM7 299 7.37x36 M1 receptor 6OIJ D2 receptor 6CM4
TM7 300 7.38x37 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM7 301 7.39x38 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
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TM7 303 7.41x40 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 5DYS
TM7 304 7.42x41 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
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TM7 306 7.44x43 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
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C-term 333 - - - - -
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G-PROTEIN TEMPLATES

Segment Seq.num. CGN# Backbone PDB Rotamer PDB
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HN 28 G.HN.46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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HN 30 G.HN.48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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