PAR4 - G(z) subunit alpha complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAZ

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 45%) PDB: 6OMM
G(i) subunit alpha-1 (sequence similarity: 79%)

RECEPTOR TEMPLATES

6OMM (FPR2/ALX)
5O9H (C5a1 receptor)
5NDD (PAR2)
5VBL (apelin receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 78.4 13.2 8.4
Side-chains 22.0 56.8 21.3

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 42

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 68 - - - - -
N-term 69 - - - - -
N-term 70 - - - - -
N-term 71 - - - - -
N-term 72 - - - - -
TM1 73 1.28x28 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 74 1.29x29 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 75 1.30x30 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 76 1.31x31 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
TM1 77 1.32x32 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM1 78 1.33x33 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM1 79 1.34x34 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 80 1.35x35 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM1 81 1.36x36 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 82 1.37x37 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM1 83 1.38x38 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM1 84 1.39x39 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM1 85 1.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 86 1.41x41 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 87 1.42x42 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM1 88 1.43x43 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM1 89 1.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 90 1.45x45 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM1 91 1.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 92 1.47x47 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM1 93 1.48x48 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM1 94 1.49x49 FPR2/ALX 6OMM PAF receptor 5ZKQ
TM1 95 1.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 96 1.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 97 1.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 98 1.53x53 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM1 99 1.54x54 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM1 100 1.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 101 1.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 102 1.57x57 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6UP7
TM1 103 1.58x58 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM1 104 1.59x59 FPR2/ALX 6OMM D4 receptor 5WIV
TM1 105 1.60x60 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 5UNF
ICL1 106 - - - - -
ICL1 107 - C5a1 receptor 5O9H - -
ICL1 108 - - - - -
TM2 109 2.37x37 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 110 2.38x38 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM2 111 2.39x39 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 112 2.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 113 2.41x41 FPR2/ALX 6OMM CCR9 5LWE
TM2 114 2.42x42 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM2 115 2.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 116 2.44x44 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 117 2.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 118 2.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 119 2.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 120 2.48x48 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 121 2.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 122 2.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 123 2.51x51 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 124 2.52x52 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 125 2.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 126 2.54x54 FPR2/ALX 6OMM Y1 receptor 5ZBH
TM2 127 2.55x55 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 128 2.56x56 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM2 129 2.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 130 2.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 131 2.59x59 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 132 2.60x60 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 133 2.61x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 134 2.62x62 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 135 2.63x63 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 136 2.64x64 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM2 137 2.65x65 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM2 138 2.66x66 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
ECL1 139 - - - - -
ECL1 140 - PAR2 5NDD - -
ECL1 141 23.49x49 PAR2 5NDD AT1 receptor 6OS2
ECL1 142 23.50x50 PAR2 5NDD PAR2 5NDD
ECL1 143 23.51x51 PAR2 5NDD LPA6 receptor 5XSZ
ECL1 144 23.52x52 - - - -
TM3 145 3.21x21 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 146 3.22x22 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM3 147 3.23x23 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM3 148 3.24x24 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM3 149 3.25x25 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 150 3.26x26 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM3 151 3.27x27 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 152 3.28x28 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 153 3.29x29 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 154 3.30x30 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 155 3.31x31 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM3 156 3.32x32 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 157 3.33x33 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 158 3.34x34 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 159 3.35x35 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 160 3.36x36 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 161 3.37x37 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 162 3.38x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 163 3.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 164 3.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 165 3.41x41 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 166 3.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 167 3.43x43 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 168 3.44x44 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM3 169 3.45x45 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 170 3.46x46 FPR2/ALX 6OMM NK1 receptor 6HLP
TM3 171 3.47x47 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 172 3.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 173 3.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 174 3.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 175 3.51x51 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM3 176 3.52x52 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 177 3.53x53 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 178 3.54x54 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM3 179 3.55x55 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 180 3.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ICL2 181 34.50x50 - - - -
ICL2 182 34.51x51 C5a1 receptor 5O9H M2 receptor 4MQT
ICL2 183 34.52x52 C5a1 receptor 5O9H A2A receptor 5G53
ICL2 184 34.53x53 C5a1 receptor 5O9H FPR2/ALX 6LW5
ICL2 185 34.54x54 C5a1 receptor 5O9H LPA6 receptor 5XSZ
ICL2 186 34.55x55 C5a1 receptor 5O9H M1 receptor 6OIJ
ICL2 187 34.56x56 C5a1 receptor 5O9H LPA6 receptor 5XSZ
ICL2 188 34.57x57 - - - -
TM4 189 4.38x38 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM4 190 4.39x39 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM4 191 4.40x40 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM4 192 4.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 193 4.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 194 4.43x43 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM4 195 4.44x44 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM4 196 4.45x45 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
TM4 197 4.46x46 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 198 4.47x47 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 199 4.48x48 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 200 4.49x49 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM4 201 4.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 202 4.51x51 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM4 203 4.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 204 4.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 205 4.54x54 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM4 206 4.55x55 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM4 207 4.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 208 4.57x57 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM4 209 4.58x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 210 4.59x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 211 4.60x61 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM4 212 4.61x62 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 213 4.62x63 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 214 - - - - -
ECL2 215 - PAR2 5NDD - -
ECL2 216 - PAR2 5NDD PAR2 5NDD
ECL2 217 - PAR2 5NDD PAR2 5NDD
ECL2 218 - PAR2 5NDD - -
ECL2 219 - PAR2 5NDD - -
ECL2 220 - PAR2 5NDD - -
ECL2 221 - PAR2 5NDD - -
ECL2 222 - PAR2 5NDD - -
ECL2 223 - PAR2 5NDD - -
ECL2 224 - PAR2 5NDD - -
ECL2 225 - PAR2 5NDD - -
ECL2 226 - PAR2 5NDD - -
ECL2 227 - - - - -
ECL2 228 45.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 229 45.51x51 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
ECL2 230 45.52x52 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
ECL2 231 - - - - -
ECL2 232 - PAR2 5NDD PAR2 5NDD
ECL2 233 - PAR2 5NDD PAR2 5NDD
ECL2 234 - PAR2 5NDD - -
ECL2 235 - PAR2 5NDD - -
ECL2 236 - - - - -
TM5 237 5.31x32 FPR2/ALX 6OMM NOP receptor 5DHG
TM5 238 5.32x33 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 239 5.33x34 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 240 5.34x35 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 241 5.35x36 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 242 5.36x37 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 243 5.37x38 FPR2/ALX 6OMM FFA1 receptor 5TZY
TM5 244 5.38x39 FPR2/ALX 6OMM FFA1 receptor 5TZY
TM5 245 5.39x40 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM5 246 5.40x41 FPR2/ALX 6OMM Y1 receptor 5ZBH
TM5 247 5.41x42 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM5 248 5.42x43 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 249 5.43x44 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM5 250 5.44x45 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 251 5.45x46 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 252 5.46x461 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 253 5.47x47 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
TM5 254 5.48x48 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 255 5.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 256 5.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 257 5.51x51 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 258 5.52x52 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM5 259 5.53x53 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM5 260 5.54x54 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 261 5.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 262 5.56x56 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM5 263 5.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 264 5.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 265 5.59x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 266 5.60x60 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM5 267 5.61x61 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 268 5.62x62 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 269 5.63x63 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 270 5.64x64 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 271 5.65x65 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 272 5.66x66 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM5 273 5.67x67 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM5 274 5.68x68 FPR2/ALX 6OMM P2Y12 receptor 4NTJ
ICL3 275 - - - - -
ICL3 276 - - - - -
ICL3 277 - - - - -
TM6 278 6.30x31 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 279 6.31x32 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 280 6.32x33 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 281 6.33x34 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM6 282 6.34x35 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM6 283 6.35x36 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 284 6.36x37 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 285 6.37x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 286 6.38x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 287 6.39x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 288 6.40x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 289 6.41x42 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 290 6.42x43 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 291 6.43x44 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 292 6.44x45 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM6 293 6.45x46 PAR2 5NDD μ receptor 5C1M
TM6 294 6.46x461 PAR2 5NDD - -
TM6 295 6.47x47 PAR2 5NDD US28 5WB1
TM6 296 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 297 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM6 298 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 299 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM6 300 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 301 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 302 6.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 303 6.55x55 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 304 6.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 305 6.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 306 6.58x58 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 307 6.59x59 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM6 308 6.60x60 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM6 309 6.61x61 FPR2/ALX 6OMM CCR9 5LWE
TM6 310 6.62x62 PAR2 5NDD - -
ECL3 311 - - - - -
ECL3 312 - PAR2 5NDD - -
ECL3 313 - PAR2 5NDD - -
ECL3 314 - PAR2 5NDD - -
ECL3 315 - PAR2 5NDD - -
ECL3 316 - PAR2 5NDD - -
ECL3 317 - - - - -
TM7 318 7.31x30 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM7 319 7.32x31 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM7 320 7.33x32 FPR2/ALX 6OMM MT2 receptor 6ME6
TM7 321 7.34x33 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM7 322 7.35x34 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM7 323 7.36x35 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
TM7 324 7.37x36 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 325 7.38x37 FPR2/ALX 6OMM OX2 receptor 5WS3
TM7 326 7.39x38 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM7 327 7.40x39 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM7 328 7.41x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 329 7.42x41 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM7 330 7.43x42 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM7 331 7.44x43 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
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G-PROTEIN TEMPLATES

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