oxoglutarate receptor - G(k) subunit alpha complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAI3

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 42%) PDB: 6OMM
G(i) subunit alpha-1 (sequence similarity: 98%)

RECEPTOR TEMPLATES

6OMM (FPR2/ALX)
4XNW (P2Y1 receptor)
5UNF (AT2 receptor)
6JOD (AT2 receptor)
4BUO (NTS1 receptor)
6RZ6 (CysLT2 receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 83.2 10.4 6.4
Side-chains 21.8 58.7 19.5

Number of backbone templates: 6
Number of rotamer templates: 43

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 26 - - - - -
N-term 27 - - - - -
N-term 28 - - - - -
N-term 29 - - - - -
N-term 30 - - - - -
TM1 31 1.30x30 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 32 1.31x31 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6IBB
TM1 33 1.32x32 FPR2/ALX 6OMM M4 receptor 6KP6
TM1 34 1.33x33 FPR2/ALX 6OMM CCR9 5LWE
TM1 35 1.34x34 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 36 1.35x35 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 37 1.36x36 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 38 1.37x37 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 39 1.38x38 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM1 40 1.39x39 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 41 1.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 42 1.41x41 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 43 1.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 44 1.43x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 45 1.44x44 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 46 1.45x45 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 47 1.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 48 1.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 49 1.48x48 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM1 50 1.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 51 1.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 52 1.51x51 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM1 53 1.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 54 1.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 55 1.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 56 1.55x55 FPR2/ALX 6OMM TP receptor 6IIV
TM1 57 1.56x56 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM1 58 1.57x57 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 59 1.58x58 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 60 1.59x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 61 1.60x60 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
ICL1 62 - - - - -
ICL1 63 - P2Y1 receptor 4XNW - -
ICL1 64 - P2Y1 receptor 4XNW P2Y1 receptor 4XNW
ICL1 65 - - - - -
TM2 66 2.37x37 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 67 2.38x38 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM2 68 2.39x39 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM2 69 2.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 70 2.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 71 2.42x42 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM2 72 2.43x43 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 73 2.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 74 2.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 75 2.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 76 2.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 77 2.48x48 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 78 2.49x49 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM2 79 2.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 80 2.51x51 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM2 81 2.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 82 2.53x53 FPR2/ALX 6OMM P2Y1 receptor 4XNW
TM2 83 2.54x54 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM2 84 2.55x55 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 85 2.56x56 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM2 86 2.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 87 2.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 88 2.59x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 89 2.60x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 90 2.61x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 91 2.62x62 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM2 92 2.63x63 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 93 2.64x64 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM2 94 2.65x65 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 95 2.66x66 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
ECL1 96 - - - - -
ECL1 97 - P2Y1 receptor 4XNW - -
ECL1 98 23.49x49 P2Y1 receptor 4XNW succinate receptor 6RNK
ECL1 99 23.50x50 P2Y1 receptor 4XNW P2Y1 receptor 4XNW
ECL1 100 23.51x51 P2Y1 receptor 4XNW P2Y1 receptor 4XNW
ECL1 101 23.52x52 - - - -
TM3 102 3.21x21 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 103 3.22x22 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 104 3.23x23 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 105 3.24x24 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 106 3.25x25 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 107 3.26x26 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 108 3.27x27 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 109 3.28x28 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 110 3.29x29 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 111 3.30x30 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM3 112 3.31x31 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 113 3.32x32 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 114 3.33x33 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 115 3.34x34 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 116 3.35x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 117 3.36x36 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 118 3.37x37 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 119 3.38x38 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM3 120 3.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 121 3.40x40 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 122 3.41x41 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 123 3.42x42 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 124 3.43x43 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 125 3.44x44 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 126 3.45x45 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 127 3.46x46 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 128 3.47x47 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 129 3.48x48 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 130 3.49x49 FPR2/ALX 6OMM CysLT1 receptor 6RZ4
TM3 131 3.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 132 3.51x51 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 133 3.52x52 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 134 3.53x53 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM3 135 3.54x54 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 136 3.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 137 3.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ICL2 138 34.50x50 - - - -
ICL2 139 34.51x51 P2Y1 receptor 4XNW AT1 receptor 6OS2
ICL2 140 34.52x52 P2Y1 receptor 4XNW Rhodopsin 4ZWJ
ICL2 141 34.53x53 P2Y1 receptor 4XNW C5a1 receptor 5O9H
ICL2 142 34.54x54 P2Y1 receptor 4XNW Rhodopsin 4ZWJ
ICL2 143 34.55x55 P2Y1 receptor 4XNW β2-adrenoceptor 3SN6
ICL2 144 34.56x56 P2Y1 receptor 4XNW CB1 receptor 6N4B
ICL2 145 34.57x57 - - - -
TM4 146 4.38x38 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM4 147 4.39x39 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM4 148 4.40x40 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM4 149 4.41x41 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 150 4.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 151 4.43x43 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM4 152 4.44x44 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 153 4.45x45 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM4 154 4.46x46 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 155 4.47x47 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 156 4.48x48 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 157 4.49x49 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM4 158 4.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 159 4.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 160 4.52x52 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2C receptor 6BQG
TM4 161 4.53x53 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM4 162 4.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 163 4.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 164 4.56x56 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 165 4.57x57 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM4 166 4.58x59 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM4 167 4.59x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 168 4.60x61 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM4 169 4.61x62 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 170 4.62x63 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM4 171 4.63x64 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 172 4.64x65 FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 173 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 174 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 175 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 176 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 177 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 178 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 179 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 180 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 181 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 182 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 183 45.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 184 45.51x51 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
ECL2 185 45.52x52 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
ECL2 186 - AT2 receptor 5UNF AT2 receptor 5UNF
ECL2 187 - - - - -
ECL2 188 - AT2 receptor 5UNF - -
ECL2 189 - AT2 receptor 5UNF - -
ECL2 190 - AT2 receptor 5UNF - -
ECL2 191 - AT2 receptor 5UNF - -
TM5 192 5.32x33 FPR2/ALX 6OMM P2Y1 receptor 4XNW
TM5 193 5.33x34 FPR2/ALX 6OMM CysLT1 receptor 6RZ4
TM5 194 5.34x35 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 195 5.35x36 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 196 5.36x37 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 197 5.37x38 FPR2/ALX 6OMM H1 receptor 3RZE
TM5 198 5.38x39 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 199 5.39x40 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM5 200 5.40x41 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 201 5.41x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 202 5.42x43 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 203 5.43x44 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 204 5.44x45 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 205 5.45x46 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM5 206 5.46x461 FPR2/ALX 6OMM OX2 receptor 5WS3
TM5 207 5.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 208 5.48x48 FPR2/ALX 6OMM P2Y1 receptor 4XNW
TM5 209 5.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 210 5.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 211 5.51x51 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 212 5.52x52 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM5 213 5.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 214 5.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 215 5.55x55 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM5 216 5.56x56 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM5 217 5.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 218 5.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 219 5.59x59 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 220 5.60x60 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 221 5.61x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 222 5.62x62 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM5 223 5.63x63 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 224 5.64x64 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 225 5.65x65 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 226 5.66x66 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 227 5.67x67 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3OE0
ICL3 228 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 229 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 230 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 231 - FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 232 6.26x26 AT2 receptor 6JOD - -
TM6 233 6.27x27 AT2 receptor 6JOD PAR2 5NDD
TM6 234 6.28x28 AT2 receptor 6JOD - -
TM6 235 6.29x29 AT2 receptor 6JOD CB2 receptor 6KPF
TM6 236 6.30x30 AT2 receptor 6JOD LPA6 receptor 5XSZ
TM6 237 6.31x31 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 238 6.32x32 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 239 6.33x33 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 240 6.34x34 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 241 6.35x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 242 6.36x36 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 243 6.37x37 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
TM6 244 6.38x38 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 245 6.39x39 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 246 6.40x40 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3ODU
TM6 247 6.41x41 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 248 6.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 249 6.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 250 6.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 251 6.45x45 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM6 252 6.46x46 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 253 6.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 254 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 255 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 256 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 257 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 258 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 259 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 260 6.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 261 6.55x55 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 262 6.56x56 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 263 6.57x57 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM6 264 6.58x58 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 265 6.59x59 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 266 6.60x60 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 267 6.61x61 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
ECL3 268 - - - - -
ECL3 269 - NTS1 receptor 4BUO - -
ECL3 270 - NTS1 receptor 4BUO - -
ECL3 271 - NTS1 receptor 4BUO - -
ECL3 272 - - - - -
TM7 273 7.24x23 P2Y1 receptor 4XNW - -
TM7 274 7.25x24 P2Y1 receptor 4XNW P2Y1 receptor 4XNW
TM7 275 7.26x25 P2Y1 receptor 4XNW CCR5 5UIW
TM7 276 7.27x26 P2Y1 receptor 4XNW AT1 receptor 6OS2
TM7 277 7.28x27 P2Y1 receptor 4XNW US28 5WB1
TM7 278 7.29x28 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM7 279 7.30x29 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM7 280 7.31x30 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 281 7.32x31 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM7 282 7.33x32 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 4LDE
TM7 283 7.34x33 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM7 284 7.35x34 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
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G-PROTEIN TEMPLATES

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