MRGPRX3 - G(i) subunit alpha-1 complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAI1

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 37%) PDB: 6OMM
G(i) subunit alpha-1 (sequence similarity: 100%)

RECEPTOR TEMPLATES

6OMM (FPR2/ALX)
6D27 (DP2 receptor)
6B73 (κ receptor)
3VW7 (PAR1)
5NDD (PAR2)
4IB4 (5-HT2B receptor)
5LWE (CCR9)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 84.1 7.9 7.9
Side-chains 17.7 57.0 25.3

Number of backbone templates: 7
Number of rotamer templates: 48

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 22 - - - - -
N-term 23 - - - - -
N-term 24 - - - - -
N-term 25 - - - - -
N-term 26 - - - - -
TM1 27 1.32x32 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM1 28 1.33x33 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 5XRA
TM1 29 1.34x34 FPR2/ALX 6OMM EP4 receptor 5YWY
TM1 30 1.35x35 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
TM1 31 1.36x36 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 32 1.37x37 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM1 33 1.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 34 1.39x39 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM1 35 1.40x40 FPR2/ALX 6OMM ETB receptor 5X93
TM1 36 1.41x41 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 37 1.42x42 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 38 1.43x43 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM1 39 1.44x44 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM1 40 1.45x45 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 41 1.46x46 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM1 42 1.47x47 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 43 1.48x48 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM1 44 1.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 45 1.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 46 1.51x51 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM1 47 1.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 48 1.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 49 1.54x54 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM1 50 1.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 51 1.56x56 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 52 1.57x57 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6UP7
TM1 53 1.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 54 1.59x59 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 5UNG
TM1 55 1.60x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ICL1 56 - - - - -
ICL1 57 - DP2 receptor 6D27 DP2 receptor 6D27
ICL1 58 - - - - -
TM2 59 2.37x37 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 60 2.38x38 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 61 2.39x39 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM2 62 2.40x40 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 63 2.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 64 2.42x42 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 65 2.43x43 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 66 2.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 67 2.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 68 2.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 69 2.47x47 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 70 2.48x48 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 71 2.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 72 2.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 73 2.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 74 2.52x52 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 75 2.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 76 2.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 77 2.55x55 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM2 78 2.56x56 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 5DYS
TM2 79 2.57x57 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 80 2.58x58 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 81 2.59x59 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 82 2.60x60 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 83 2.61x61 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 84 2.62x62 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 85 2.63x63 FPR2/ALX 6OMM D2 receptor 6CM4
TM2 86 2.64x64 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 87 2.65x65 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 88 2.66x66 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
ECL1 89 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL1 90 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL1 91 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL1 92 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL1 93 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 94 3.24x24 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 95 3.25x25 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 96 3.26x26 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 97 3.27x27 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 98 3.28x28 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 99 3.29x29 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 100 3.30x30 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 101 3.31x31 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 102 3.32x32 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM3 103 3.33x33 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 104 3.34x34 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 105 3.35x35 FPR2/ALX 6OMM FFA1 receptor 5TZY
TM3 106 3.36x36 FPR2/ALX 6OMM CCR2 5T1A
TM3 107 3.37x37 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 108 3.38x38 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 5DYS
TM3 109 3.39x39 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM3 110 3.40x40 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 111 3.41x41 FPR2/ALX 6OMM EP4 receptor 5YWY
TM3 112 3.42x42 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 113 3.43x43 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 114 3.44x44 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM3 115 3.45x45 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM3 116 3.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 117 3.47x47 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 118 3.48x48 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 119 3.49x49 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM3 120 3.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 121 3.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 122 3.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 123 3.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 124 3.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 125 3.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 126 3.56x56 FPR2/ALX 6OMM - -
ICL2 127 34.50x50 - - - -
ICL2 128 34.51x51 DP2 receptor 6D27 C5a1 receptor 6C1R
ICL2 129 34.52x52 DP2 receptor 6D27 DP2 receptor 6D27
ICL2 130 34.53x53 DP2 receptor 6D27 A1 receptor 6D9H
ICL2 131 34.54x54 DP2 receptor 6D27 MT2 receptor 6ME6
ICL2 132 34.55x55 DP2 receptor 6D27 - -
ICL2 133 34.56x56 DP2 receptor 6D27 AT1 receptor 6OS2
ICL2 134 34.57x57 - - - -
TM4 135 4.38x38 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM4 136 4.39x39 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM4 137 4.40x40 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 138 4.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 139 4.42x42 FPR2/ALX 6OMM CCR9 5LWE
TM4 140 4.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 141 4.44x44 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 142 4.45x45 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM4 143 4.46x46 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 144 4.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 145 4.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 146 4.49x49 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM4 147 4.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 148 4.51x51 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2C receptor 6BQG
TM4 149 4.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 150 4.53x53 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM4 151 4.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 152 4.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 153 4.56x56 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 154 4.57x57 κ receptor 6B73 AT2 receptor 6JOD
TM4 155 4.58x58 κ receptor 6B73 κ receptor 6B73
TM4 156 4.59x59 κ receptor 6B73 AT2 receptor 6JOD
TM4 157 4.60x60 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 158 4.61x61 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 159 4.62x62 FPR2/ALX 6OMM apelin receptor 5VBL
TM4 160 4.63x63 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM4 161 4.64x64 FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 162 - - - - -
ECL2 163 - - - - -
ECL2 164 - - - - -
TM5 165 5.26x26 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 166 5.27x27 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 167 5.28x28 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 168 5.29x29 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 169 5.30x30 FPR2/ALX 6OMM CysLT1 receptor 6RZ4
TM5 170 5.31x31 FPR2/ALX 6OMM apelin receptor 5VBL
TM5 171 5.32x32 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 172 5.33x33 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM5 173 5.34x34 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 174 5.35x35 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 175 5.36x36 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 176 5.37x37 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 177 5.38x38 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 178 5.39x39 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 179 5.40x40 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 180 5.41x41 FPR2/ALX 6OMM GPR52 6LI1
TM5 181 5.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 182 5.43x43 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
TM5 183 5.44x44 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 184 5.45x45 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 185 5.46x46 PAR1 3VW7 LPA6 receptor 5XSZ
TM5 186 5.47x47 PAR1 3VW7 PAR1 3VW7
TM5 187 5.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 188 5.49x49 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 189 5.50x50 FPR2/ALX 6OMM PAF receptor 5ZKQ
TM5 190 5.51x51 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 191 5.52x52 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 192 5.53x53 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 193 5.54x54 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 194 5.55x55 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 195 5.56x56 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM5 196 5.57x57 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 197 5.58x58 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 198 5.59x59 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM5 199 5.60x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 200 5.61x61 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 201 5.62x62 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 202 5.63x63 FPR2/ALX 6OMM NK1 receptor 6HLP
TM5 203 5.64x64 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM5 204 5.65x65 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 205 5.66x66 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 206 5.67x67 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 207 5.68x68 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
ICL3 208 - - - - -
ICL3 209 - - - - -
ICL3 210 - - - - -
TM6 211 6.30x30 PAR2 5NDD μ receptor 5C1M
TM6 212 6.31x31 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM6 213 6.32x32 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 214 6.33x33 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM6 215 6.34x34 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 216 6.35x35 FPR2/ALX 6OMM MT1 receptor 6ME2
TM6 217 6.36x36 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM6 218 6.37x37 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 219 6.38x38 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 220 6.39x39 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM6 221 6.40x40 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM6 222 6.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 223 6.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 224 6.43x43 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 225 6.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 226 6.45x45 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2C receptor 6BQG
TM6 227 6.46x46 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM6 228 6.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 229 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 230 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 231 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 232 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 233 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 234 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 235 6.54x54 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 236 6.55x55 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 237 6.56x56 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM6 238 6.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 239 6.58x58 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM6 240 6.59x59 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 241 6.60x60 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM6 242 6.61x61 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
ECL3 243 - - - - -
ECL3 244 - 5-HT2B receptor 4IB4 - -
ECL3 245 - - - - -
TM7 246 7.27x26 DP2 receptor 6D27 - -
TM7 247 7.28x27 DP2 receptor 6D27 CysLT2 receptor 6RZ6
TM7 248 7.29x28 FPR2/ALX 6OMM - -
TM7 249 7.30x29 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2C receptor 6BQG
TM7 250 7.31x30 FPR2/ALX 6OMM - -
TM7 251 7.32x31 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM7 252 7.33x32 FPR2/ALX 6OMM H1 receptor 3RZE
TM7 253 7.34x33 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM7 254 7.35x34 FPR2/ALX 6OMM H1 receptor 3RZE
TM7 255 7.36x35 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM7 256 7.37x36 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM7 257 7.38x37 FPR2/ALX 6OMM MT2 receptor 6ME6
TM7 258 7.39x38 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM7 259 7.40x39 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM7 260 7.41x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 261 7.42x41 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM7 262 7.43x42 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
TM7 263 7.44x43 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM7 264 7.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 265 7.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 266 7.47x47 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM7 267 7.48x48 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM7 268 7.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 269 7.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 270 7.51x51 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM7 271 7.52x52 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM7 272 7.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 273 7.54x54 FPR2/ALX 6OMM P2Y1 receptor 4XNW
TM7 274 7.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 275 7.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
H8 276 8.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
H8 277 8.48x48 FPR2/ALX 6OMM GPR52 6LI1
H8 278 8.49x49 FPR2/ALX 6OMM - -
H8 279 8.50x50 FPR2/ALX 6OMM - -
H8 280 8.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
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G-PROTEIN TEMPLATES

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