MRGPRD - G(k) subunit alpha complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAI3

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 35%) PDB: 6OMM
G(i) subunit alpha-1 (sequence similarity: 98%)

RECEPTOR TEMPLATES

6OMM (FPR2/ALX)
5O9H (C5a1 receptor)
4XNW (P2Y1 receptor)
6MEO (CCR5)
5NDD (PAR2)
3VG9 (A2A receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 84.1 6.5 9.4
Side-chains 18.8 59.8 21.4

Number of backbone templates: 6
Number of rotamer templates: 56

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 19 - - - - -
N-term 20 - - - - -
N-term 21 - - - - -
N-term 22 - - - - -
N-term 23 - - - - -
TM1 24 1.29x29 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 25 1.30x30 FPR2/ALX 6OMM ETB receptor 5X93
TM1 26 1.31x31 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM1 27 1.32x32 FPR2/ALX 6OMM PAF receptor 5ZKQ
TM1 28 1.33x33 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 5XRA
TM1 29 1.34x34 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 30 1.35x35 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 31 1.36x36 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 32 1.37x37 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM1 33 1.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 34 1.39x39 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM1 35 1.40x40 FPR2/ALX 6OMM apelin receptor 5VBL
TM1 36 1.41x41 FPR2/ALX 6OMM M3 receptor 5ZHP
TM1 37 1.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 38 1.43x43 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM1 39 1.44x44 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 40 1.45x45 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 41 1.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 42 1.47x47 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 43 1.48x48 FPR2/ALX 6OMM D4 receptor 5WIV
TM1 44 1.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 45 1.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 46 1.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 47 1.52x52 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM1 48 1.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 49 1.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 50 1.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 51 1.56x56 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 52 1.57x57 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6UP7
TM1 53 1.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 54 1.59x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 55 1.60x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ICL1 56 - - - - -
ICL1 57 - C5a1 receptor 5O9H - -
ICL1 58 - - - - -
TM2 59 2.37x37 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM2 60 2.38x38 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6KPG
TM2 61 2.39x39 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM2 62 2.40x40 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 63 2.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 64 2.42x42 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 65 2.43x43 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 66 2.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 67 2.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 68 2.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 69 2.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 70 2.48x48 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 71 2.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 72 2.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 73 2.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 74 2.52x52 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 75 2.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 76 2.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 77 2.55x55 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 5DYS
TM2 78 2.56x56 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM2 79 2.57x57 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 80 2.58x58 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM2 81 2.59x59 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM2 82 2.60x60 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 6FK6
TM2 83 2.61x61 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM2 84 2.62x62 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM2 85 2.63x63 FPR2/ALX 6OMM S1P1 receptor 3V2Y
TM2 86 2.64x64 FPR2/ALX 6OMM D2 receptor 6CM4
TM2 87 2.65x65 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM2 88 2.66x66 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
ECL1 89 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL1 90 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL1 91 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL1 92 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL1 93 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 94 3.21x21 FPR2/ALX 6OMM S1P1 receptor 3V2Y
TM3 95 3.22x22 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 96 3.23x23 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2A receptor 6A94
TM3 97 3.24x24 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM3 98 3.25x25 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 99 3.26x26 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 100 3.27x27 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 101 3.28x28 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
TM3 102 3.29x29 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 103 3.30x30 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 104 3.31x31 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM3 105 3.32x32 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM3 106 3.33x33 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 107 3.34x34 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 108 3.35x35 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 109 3.36x36 FPR2/ALX 6OMM CCR2 5T1A
TM3 110 3.37x37 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 5XRA
TM3 111 3.38x38 FPR2/ALX 6OMM OX1 receptor 6TO7
TM3 112 3.39x39 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM3 113 3.40x40 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 114 3.41x41 FPR2/ALX 6OMM EP4 receptor 5YWY
TM3 115 3.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 116 3.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 117 3.44x44 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 118 3.45x45 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM3 119 3.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 120 3.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 121 3.48x48 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 122 3.49x49 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM3 123 3.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 124 3.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 125 3.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 126 3.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 127 3.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 128 3.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 129 3.56x56 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
ICL2 130 34.50x50 - - - -
ICL2 131 34.51x51 C5a1 receptor 5O9H C5a1 receptor 6C1R
ICL2 132 34.52x52 C5a1 receptor 5O9H C5a1 receptor 5O9H
ICL2 133 34.53x53 C5a1 receptor 5O9H - -
ICL2 134 34.54x54 C5a1 receptor 5O9H NTS1 receptor 5T04
ICL2 135 34.55x55 C5a1 receptor 5O9H - -
ICL2 136 34.56x56 C5a1 receptor 5O9H FPR2/ALX 6LW5
ICL2 137 34.57x57 - - - -
TM4 138 4.38x38 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM4 139 4.39x39 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM4 140 4.40x40 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 141 4.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 142 4.42x42 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM4 143 4.43x43 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM4 144 4.44x44 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM4 145 4.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 146 4.46x46 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 147 4.47x47 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM4 148 4.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 149 4.49x49 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM4 150 4.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 151 4.51x51 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 5XRA
TM4 152 4.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 153 4.53x53 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 154 4.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 155 4.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 156 4.56x56 FPR2/ALX 6OMM LPA1 receptor 4Z35
TM4 157 4.57x57 P2Y1 receptor 4XNW - -
TM4 158 4.58x58 P2Y1 receptor 4XNW S1P1 receptor 3V2Y
TM4 159 4.59x59 P2Y1 receptor 4XNW P2Y1 receptor 4XNW
TM4 160 4.60x60 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 161 4.61x61 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
TM4 162 4.62x62 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 163 4.63x63 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM4 164 4.64x64 FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 165 - - - - -
ECL2 166 - - - - -
ECL2 167 - - - - -
ECL2 168 - - - - -
ECL2 169 - - - - -
ECL2 170 - - - - -
ECL2 171 - - - - -
ECL2 172 - - - - -
TM5 173 5.31x32 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 174 5.32x33 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 175 5.33x34 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 176 5.34x35 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 177 5.35x36 FPR2/ALX 6OMM Y1 receptor 5ZBH
TM5 178 5.36x37 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3ODU
TM5 179 5.37x38 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM5 180 5.38x39 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6VI4
TM5 181 5.39x40 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 182 5.40x41 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 183 5.41x42 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 184 5.42x43 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
TM5 185 5.43x44 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM5 186 5.44x45 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 187 5.45x46 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 188 5.46x461 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 189 5.47x47 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 5XRA
TM5 190 5.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 191 5.49x49 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 192 5.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 193 5.51x51 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 194 5.52x52 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 195 5.53x53 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
TM5 196 5.54x54 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM5 197 5.55x55 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM5 198 5.56x56 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM5 199 5.57x57 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 200 5.58x58 FPR2/ALX 6OMM GPR52 6LI1
TM5 201 5.59x59 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM5 202 5.60x60 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
TM5 203 5.61x61 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 204 5.62x62 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 205 5.63x63 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 206 5.64x64 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 207 5.65x65 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 208 5.66x66 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM5 209 5.67x67 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 210 5.68x68 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
ICL3 211 - - - - -
ICL3 212 - CCR5 6MEO - -
ICL3 213 - - - - -
TM6 214 6.28x28 PAR2 5NDD μ receptor 6DDF
TM6 215 6.29x29 PAR2 5NDD CXCR4 3ODU
TM6 216 6.30x30 PAR2 5NDD - -
TM6 217 6.31x31 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM6 218 6.32x32 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 219 6.33x33 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM6 220 6.34x34 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 221 6.35x35 FPR2/ALX 6OMM MT1 receptor 6ME2
TM6 222 6.36x36 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 223 6.37x37 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 224 6.38x38 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 225 6.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 226 6.40x40 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 227 6.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 228 6.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 229 6.43x43 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 230 6.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 231 6.45x45 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 5DYS
TM6 232 6.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 233 6.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 234 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM EP4 receptor 5YWY
TM6 235 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 236 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 237 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM6 238 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM OX1 receptor 6TO7
TM6 239 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 240 6.54x54 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM6 241 6.55x55 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 242 6.56x56 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 243 6.57x57 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 244 6.58x58 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 245 6.59x59 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM6 246 6.60x60 FPR2/ALX 6OMM Y1 receptor 5ZBH
TM6 247 6.61x61 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
ECL3 248 - - - - -
ECL3 249 - A2A receptor 3VG9 - -
ECL3 250 - A2A receptor 3VG9 - -
ECL3 251 - A2A receptor 3VG9 - -
ECL3 252 - A2A receptor 3VG9 - -
ECL3 253 - - - - -
TM7 254 7.31x30 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM7 255 7.32x31 FPR2/ALX 6OMM NOP receptor 5DHG
TM7 256 7.33x32 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM7 257 7.34x33 FPR2/ALX 6OMM OX1 receptor 4ZJ8
TM7 258 7.35x34 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM7 259 7.36x35 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
TM7 260 7.37x36 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM7 261 7.38x37 FPR2/ALX 6OMM OX1 receptor 6TO7
TM7 262 7.39x38 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM7 263 7.40x39 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM7 264 7.41x40 FPR2/ALX 6OMM - -
TM7 265 7.42x41 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM7 266 7.43x42 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM7 267 7.44x43 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM7 268 7.45x45 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM7 269 7.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 270 7.47x47 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM7 271 7.48x48 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM7 272 7.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 273 7.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 274 7.51x51 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 6DDF
TM7 275 7.52x52 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM7 276 7.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 277 7.54x54 FPR2/ALX 6OMM P2Y1 receptor 4XNW
TM7 278 7.55x55 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
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