BLT2 receptor - G(i) subunit alpha-1 complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAI1

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 42%) PDB: 6OMM
G(i) subunit alpha-1 (sequence similarity: 100%)

RECEPTOR TEMPLATES

6OMM (FPR2/ALX)
5X33 (BLT1 receptor)
4YAY (AT1 receptor)
4ZUD (AT1 receptor)
6B73 (κ receptor)
4XNW (P2Y1 receptor)
5LWE (CCR9)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 81.0 11.3 7.7
Side-chains 22.7 54.7 22.7

Number of backbone templates: 7
Number of rotamer templates: 42

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 46 - - - - -
N-term 47 - - - - -
N-term 48 - - - - -
N-term 49 - - - - -
N-term 50 - - - - -
TM1 51 1.32x32 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 52 1.33x33 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM1 53 1.34x34 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM1 54 1.35x35 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 55 1.36x36 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 56 1.37x37 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 57 1.38x38 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 58 1.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 59 1.40x40 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM1 60 1.41x41 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 61 1.42x42 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM1 62 1.43x43 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM1 63 1.44x44 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 64 1.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 65 1.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 66 1.47x47 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 67 1.48x48 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM1 68 1.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 69 1.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 70 1.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 71 1.52x52 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM1 72 1.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 73 1.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 74 1.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 75 1.56x56 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM1 76 1.57x57 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6UP7
TM1 77 1.58x58 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM1 78 1.59x59 FPR2/ALX 6OMM TP receptor 6IIV
TM1 79 1.60x60 FPR2/ALX 6OMM - -
ICL1 80 12.48x48 - - - -
ICL1 81 12.49x49 - - - -
ICL1 82 12.50x50 - - - -
ICL1 83 12.51x51 - - - -
TM2 84 2.35x35 - - - -
TM2 85 2.36x36 - - - -
TM2 86 2.37x37 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 87 2.38x38 FPR2/ALX 6OMM CCR2 5T1A
TM2 88 2.39x39 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 89 2.40x40 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM2 90 2.41x41 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 91 2.42x42 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM2 92 2.43x43 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM2 93 2.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 94 2.45x45 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM2 95 2.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 96 2.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 97 2.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 98 2.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 99 2.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 100 2.51x51 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 101 2.52x52 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM2 102 2.53x53 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 103 2.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 104 2.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 105 2.56x56 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 106 2.57x57 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM2 107 2.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 108 2.59x59 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 109 2.60x60 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM2 110 2.61x61 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 111 2.62x62 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 112 2.63x63 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM2 113 2.64x64 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 114 2.65x65 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM2 115 2.66x66 FPR2/ALX 6OMM apelin receptor 5VBL
ECL1 116 - - - - -
ECL1 117 23.49x49 BLT1 receptor 5X33 D4 receptor 5WIV
ECL1 118 23.50x50 BLT1 receptor 5X33 BLT1 receptor 5X33
ECL1 119 23.51x51 BLT1 receptor 5X33 AT1 receptor 6OS2
ECL1 120 23.52x52 - - - -
TM3 121 3.21x21 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 122 3.22x22 FPR2/ALX 6OMM OX2 receptor 5WS3
TM3 123 3.23x23 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM3 124 3.24x24 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM3 125 3.25x25 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 126 3.26x26 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 127 3.27x27 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 128 3.28x28 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 129 3.29x29 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM3 130 3.30x30 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 131 3.31x31 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 132 3.32x32 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM3 133 3.33x33 FPR2/ALX 6OMM OX1 receptor 6TO7
TM3 134 3.34x34 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 135 3.35x35 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM3 136 3.36x36 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 137 3.37x37 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 138 3.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 139 3.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 140 3.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 141 3.41x41 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 142 3.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 143 3.43x43 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 144 3.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 145 3.45x45 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM3 146 3.46x46 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 147 3.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 148 3.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 149 3.49x49 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM3 150 3.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 151 3.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 152 3.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 153 3.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 154 3.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 155 3.55x55 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 156 3.56x56 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
ICL2 157 34.50x50 - - - -
ICL2 158 34.51x51 BLT1 receptor 5X33 BLT1 receptor 5X33
ICL2 159 34.52x52 BLT1 receptor 5X33 BLT1 receptor 5X33
ICL2 160 34.53x53 BLT1 receptor 5X33 FPR2/ALX 6LW5
ICL2 161 34.54x54 BLT1 receptor 5X33 M2 receptor 4MQT
ICL2 162 34.55x55 BLT1 receptor 5X33 Rhodopsin 4ZWJ
ICL2 163 34.56x56 BLT1 receptor 5X33 LPA6 receptor 5XSZ
ICL2 164 34.57x57 - - - -
TM4 165 4.38x38 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM4 166 4.39x39 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM4 167 4.40x40 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 168 4.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 169 4.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 170 4.43x43 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 171 4.44x44 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 172 4.45x45 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM4 173 4.46x46 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM4 174 4.47x47 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM4 175 4.48x48 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 176 4.49x49 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 177 4.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 178 4.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 179 4.52x52 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM4 180 4.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 181 4.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 182 4.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 183 4.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 184 4.57x57 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 185 4.58x59 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM4 186 4.59x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 187 4.60x61 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 188 4.61x62 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM4 189 4.62x63 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2C receptor 6BQG
TM4 190 4.63x64 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM4 191 4.64x65 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6DO1
ECL2 192 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 193 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 194 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 195 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 196 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 197 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 198 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 199 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 200 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 201 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 202 45.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 203 45.51x51 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
ECL2 204 45.52x52 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
ECL2 205 - AT1 receptor 4YAY AT1 receptor 4YAY
ECL2 206 - - - - -
ECL2 207 - AT1 receptor 4YAY - -
ECL2 208 - AT1 receptor 4YAY - -
TM5 209 5.35x36 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 210 5.36x37 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 211 5.37x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 212 5.38x39 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM5 213 5.39x40 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM5 214 5.40x41 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM5 215 5.41x42 FPR2/ALX 6OMM Y1 receptor 5ZBH
TM5 216 5.42x43 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM5 217 5.43x44 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM5 218 5.44x45 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 219 5.45x46 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM5 220 5.46x461 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 221 5.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 222 5.48x48 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 223 5.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 224 5.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 225 5.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 226 5.52x52 FPR2/ALX 6OMM OX1 receptor 6TO7
TM5 227 5.53x53 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 228 5.54x54 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 229 5.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 230 5.56x56 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM5 231 5.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 232 5.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 233 5.59x59 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 234 5.60x60 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 235 5.61x61 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 236 5.62x62 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 237 5.63x63 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 238 5.64x64 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 239 5.65x65 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 240 5.66x66 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 241 5.67x67 FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 242 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 243 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 244 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 245 - FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 246 6.26x26 κ receptor 6B73 5-HT2A receptor 6A94
TM6 247 6.27x27 κ receptor 6B73 EP3 receptor 6AK3
TM6 248 6.28x28 κ receptor 6B73 μ receptor 6DDF
TM6 249 6.29x29 κ receptor 6B73 US28 5WB1
TM6 250 6.30x30 κ receptor 6B73 - -
TM6 251 6.31x31 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 252 6.32x32 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 253 6.33x33 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 254 6.34x34 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 255 6.35x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 256 6.36x36 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 257 6.37x37 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 258 6.38x38 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM6 259 6.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 260 6.40x40 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 261 6.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 262 6.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 263 6.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 264 6.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 265 6.45x45 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 266 6.46x46 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 267 6.47x47 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 268 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 269 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM6 270 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 271 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 272 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 273 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM6 274 6.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 275 6.55x55 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 276 6.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 277 6.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 278 6.58x58 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM6 279 6.59x59 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 280 6.60x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 281 6.61x61 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 282 6.62x62 AT1 receptor 4ZUD CCR9 5LWE
TM6 283 6.63x63 AT1 receptor 4ZUD AT1 receptor 6OS2
TM6 284 6.64x64 AT1 receptor 4ZUD CCR9 5LWE
ECL3 285 - - - - -
ECL3 286 - P2Y1 receptor 4XNW - -
ECL3 287 - P2Y1 receptor 4XNW - -
ECL3 288 - P2Y1 receptor 4XNW - -
ECL3 289 - - - - -
TM7 290 7.24x23 AT1 receptor 4ZUD - -
TM7 291 7.25x24 AT1 receptor 4ZUD - -
TM7 292 7.26x25 AT1 receptor 4ZUD - -
TM7 293 7.27x26 AT1 receptor 4ZUD NTS1 receptor 5T04
TM7 294 7.28x27 AT1 receptor 4ZUD - -
TM7 295 7.29x28 FPR2/ALX 6OMM - -
TM7 296 7.30x29 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM7 297 7.31x30 FPR2/ALX 6OMM - -
TM7 298 7.32x31 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM7 299 7.33x32 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM7 300 7.34x33 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM7 301 7.35x34 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM7 302 7.36x35 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
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G-PROTEIN TEMPLATES

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