BLT1 receptor - G(i) subunit alpha-1 complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAI1

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 44%) PDB: 6OMM
G(i) subunit alpha-1 (sequence similarity: 100%)

RECEPTOR TEMPLATES

6OMM (FPR2/ALX)
4ZUD (AT1 receptor)
4YAY (AT1 receptor)
5X33 (BLT1 receptor)
4XNW (P2Y1 receptor)
5VBL (apelin receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 85.5 8.1 6.4
Side-chains 24.9 59.3 15.8

Number of backbone templates: 6
Number of rotamer templates: 41

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 10 - - - - -
N-term 11 - - - - -
N-term 12 - - - - -
N-term 13 - - - - -
N-term 14 - - - - -
TM1 15 1.29x29 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 4LDE
TM1 16 1.30x30 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQS
TM1 17 1.31x31 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 18 1.32x32 FPR2/ALX 6OMM CCR9 5LWE
TM1 19 1.33x33 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 5XRA
TM1 20 1.34x34 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 21 1.35x35 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM1 22 1.36x36 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM1 23 1.37x37 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 24 1.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 25 1.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 26 1.40x40 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 27 1.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 28 1.42x42 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM1 29 1.43x43 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM1 30 1.44x44 FPR2/ALX 6OMM δ receptor 4N6H
TM1 31 1.45x45 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 32 1.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 33 1.47x47 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 34 1.48x48 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM1 35 1.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 36 1.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 37 1.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 38 1.52x52 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM1 39 1.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 40 1.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 41 1.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 42 1.56x56 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM1 43 1.57x57 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 44 1.58x58 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 45 1.59x59 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 46 1.60x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ICL1 47 12.48x48 - - - -
ICL1 48 12.49x49 AT1 receptor 4ZUD CB2 receptor 6KPF
ICL1 49 12.50x50 AT1 receptor 4ZUD - -
ICL1 50 12.51x51 - - - -
TM2 51 2.37x37 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM2 52 2.38x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 53 2.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 54 2.40x40 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM2 55 2.41x41 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM2 56 2.42x42 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM2 57 2.43x43 FPR2/ALX 6OMM A2A receptor 5G53
TM2 58 2.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 59 2.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 60 2.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 61 2.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 62 2.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 63 2.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 64 2.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 65 2.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 66 2.52x52 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM2 67 2.53x53 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 68 2.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 69 2.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 70 2.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 71 2.57x57 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM2 72 2.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 73 2.59x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 74 2.60x60 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM2 75 2.61x61 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 76 2.62x62 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM2 77 2.63x63 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM2 78 2.64x64 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM2 79 2.65x65 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 80 2.66x66 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
ECL1 81 - - - - -
ECL1 82 23.49x49 BLT1 receptor 5X33 BLT1 receptor 5X33
ECL1 83 23.50x50 BLT1 receptor 5X33 BLT1 receptor 5X33
ECL1 84 23.51x51 BLT1 receptor 5X33 BLT1 receptor 5X33
ECL1 85 23.52x52 - - - -
TM3 86 3.21x21 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 87 3.22x22 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 88 3.23x23 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM3 89 3.24x24 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM3 90 3.25x25 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 91 3.26x26 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM3 92 3.27x27 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 93 3.28x28 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM3 94 3.29x29 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 95 3.30x30 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 96 3.31x31 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 97 3.32x32 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM3 98 3.33x33 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM3 99 3.34x34 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM3 100 3.35x35 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM3 101 3.36x36 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 102 3.37x37 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 103 3.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 104 3.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 105 3.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 106 3.41x41 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 107 3.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 108 3.43x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 109 3.44x44 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 110 3.45x45 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 111 3.46x46 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 112 3.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 113 3.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 114 3.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 115 3.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 116 3.51x51 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM3 117 3.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 118 3.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 119 3.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 120 3.55x55 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM3 121 3.56x56 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
ICL2 122 34.50x50 - - - -
ICL2 123 34.51x51 BLT1 receptor 5X33 BLT1 receptor 5X33
ICL2 124 34.52x52 BLT1 receptor 5X33 - -
ICL2 125 34.53x53 BLT1 receptor 5X33 BLT1 receptor 5X33
ICL2 126 34.54x54 BLT1 receptor 5X33 BLT1 receptor 5X33
ICL2 127 34.55x55 BLT1 receptor 5X33 BLT1 receptor 5X33
ICL2 128 34.56x56 BLT1 receptor 5X33 LPA6 receptor 5XSZ
ICL2 129 34.57x57 - - - -
TM4 130 4.38x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 131 4.39x39 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 132 4.40x40 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 133 4.41x41 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQS
TM4 134 4.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 135 4.43x43 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 136 4.44x44 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 137 4.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 138 4.46x46 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM4 139 4.47x47 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 140 4.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 141 4.49x49 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 142 4.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 143 4.51x51 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 144 4.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 145 4.53x53 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM4 146 4.54x54 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM4 147 4.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 148 4.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 149 4.57x57 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 150 4.58x59 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM4 151 4.59x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 152 4.60x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 153 4.61x62 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM4 154 4.62x63 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM4 155 4.63x64 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM4 156 4.64x65 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6DO1
ECL2 157 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 158 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 159 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 160 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 161 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 162 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 163 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 164 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 165 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 166 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 167 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 168 45.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 169 45.51x51 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
ECL2 170 45.52x52 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
ECL2 171 - - - - -
TM5 172 5.29x30 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 173 5.30x31 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 174 5.31x32 FPR2/ALX 6OMM δ receptor 4N6H
TM5 175 5.32x33 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 176 5.33x34 FPR2/ALX 6OMM CCR2 5T1A
TM5 177 5.34x35 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 178 5.35x36 FPR2/ALX 6OMM Y1 receptor 5ZBH
TM5 179 5.36x37 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 180 5.37x38 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 181 5.38x39 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM5 182 5.39x40 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM5 183 5.40x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 184 5.41x42 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 185 5.42x43 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM5 186 5.43x44 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM5 187 5.44x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 188 5.45x46 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM5 189 5.46x461 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 190 5.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 191 5.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 192 5.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 193 5.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 194 5.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 195 5.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 196 5.53x53 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM5 197 5.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 198 5.55x55 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 199 5.56x56 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM5 200 5.57x57 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 201 5.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 202 5.59x59 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 203 5.60x60 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM5 204 5.61x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 205 5.62x62 FPR2/ALX 6OMM NK1 receptor 6HLP
TM5 206 5.63x63 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM5 207 5.64x64 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 208 5.65x65 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 209 5.66x66 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 210 5.67x67 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM5 211 5.68x68 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
ICL3 212 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 213 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 214 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 215 - FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 216 6.30x30 AT1 receptor 4YAY C5a1 receptor 6C1R
TM6 217 6.31x31 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM6 218 6.32x32 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 219 6.33x33 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM6 220 6.34x34 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 221 6.35x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 222 6.36x36 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 223 6.37x37 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 224 6.38x38 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 225 6.39x39 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 226 6.40x40 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 227 6.41x41 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM6 228 6.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 229 6.43x43 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 230 6.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 231 6.45x45 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM6 232 6.46x46 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM6 233 6.47x47 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 234 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 235 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 236 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 237 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 238 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 239 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 240 6.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 241 6.55x55 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 242 6.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 243 6.57x57 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM6 244 6.58x58 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM6 245 6.59x59 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 246 6.60x60 FPR2/ALX 6OMM S1P1 receptor 3V2Y
TM6 247 6.61x61 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM6 248 6.62x62 AT1 receptor 4ZUD CCR9 5LWE
TM6 249 6.63x63 AT1 receptor 4ZUD AT1 receptor 6OS2
TM6 250 6.64x64 AT1 receptor 4ZUD CCR9 5LWE
ECL3 251 - - - - -
ECL3 252 - P2Y1 receptor 4XNW P2Y1 receptor 4XNW
ECL3 253 - P2Y1 receptor 4XNW - -
ECL3 254 - P2Y1 receptor 4XNW - -
ECL3 255 - - - - -
TM7 256 7.24x23 AT1 receptor 4ZUD - -
TM7 257 7.25x24 AT1 receptor 4ZUD - -
TM7 258 7.26x25 AT1 receptor 4ZUD - -
TM7 259 7.27x26 AT1 receptor 4ZUD AT2 receptor 6JOD
TM7 260 7.28x27 AT1 receptor 4ZUD - -
TM7 261 7.29x28 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 262 7.30x29 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM7 263 7.31x30 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM7 264 7.32x31 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM7 265 7.33x32 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM7 266 7.34x33 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM7 267 7.35x34 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM7 268 7.36x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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TM7 276 7.44x43 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
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TM7 281 7.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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C-term 303 - - - - -
C-term 304 - - - - -
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G-PROTEIN TEMPLATES

Segment Seq.num. CGN# Backbone PDB Rotamer PDB
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