GPR62 - subunit alpha-11 complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNA11

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 27%) PDB: 6OIJ
subunit alpha-11 (sequence similarity: 100%)

RECEPTOR TEMPLATES

5JQH (β2-adrenoceptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
6OIJ (M1 receptor)
3PBL (D3 receptor)
4PXZ (P2Y12 receptor)
6ME6 (MT2 receptor)
6TO7 (OX1 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 77.8 8.4 13.8
Side-chains 14.8 54.5 30.6

Number of backbone templates: 7
Number of rotamer templates: 46

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 6 - - - - -
N-term 7 - - - - -
N-term 8 - - - - -
N-term 9 - - - - -
N-term 10 - - - - -
TM1 11 1.29x29 β2-adrenoceptor 5JQH β2-adrenoceptor 4LDE
TM1 12 1.30x30 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 13 1.31x31 M1 receptor 6OIJ CCR5 5UIW
TM1 14 1.32x32 M1 receptor 6OIJ D4 receptor 5WIV
TM1 15 1.33x33 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 16 1.34x34 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 17 1.35x35 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 18 1.36x36 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM1 19 1.37x37 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 20 1.38x38 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 21 1.39x39 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM1 22 1.40x40 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 23 1.41x41 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM1 24 1.42x42 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 25 1.43x43 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 26 1.44x44 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 27 1.45x45 M1 receptor 6OIJ NOP receptor 5DHG
TM1 28 1.46x46 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 29 1.47x47 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM1 30 1.48x48 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 31 1.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 32 1.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 33 1.51x51 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM1 34 1.52x52 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM1 35 1.53x53 M1 receptor 6OIJ Y1 receptor 5ZBH
TM1 36 1.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 37 1.55x55 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM1 38 1.56x56 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM1 39 1.57x57 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 40 1.58x58 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM1 41 1.59x59 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM1 42 1.60x60 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
ICL1 43 - - - - -
ICL1 44 - - - - -
TM2 45 2.37x37 D3 receptor 3PBL - -
TM2 46 2.38x38 D3 receptor 3PBL - -
TM2 47 2.39x39 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 48 2.40x40 M1 receptor 6OIJ BLT1 receptor 5X33
TM2 49 2.41x41 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM2 50 2.42x42 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM2 51 2.43x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 52 2.44x44 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 53 2.45x45 M1 receptor 6OIJ DP2 receptor 6D27
TM2 54 2.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 55 2.47x47 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 56 2.48x48 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 57 2.49x49 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 58 2.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 59 2.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 60 2.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 61 2.53x53 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM2 62 2.54x54 M1 receptor 6OIJ D3 receptor 3PBL
TM2 63 2.55x55 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 64 2.56x551 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 65 2.57x56 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM2 66 2.58x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 67 2.59x58 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 68 2.60x59 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 69 2.61x60 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 70 2.62x61 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 71 2.63x62 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 72 2.64x63 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM2 73 2.65x64 M1 receptor 6OIJ CXCR4 3ODU
TM2 74 2.66x65 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 75 2.67x66 M1 receptor 6OIJ - -
ECL1 76 - - - - -
ECL1 77 - - - - -
ECL1 78 - - - - -
ECL1 79 - - - - -
ECL1 80 - - - - -
TM3 81 3.18x18 P2Y12 receptor 4PXZ - -
TM3 82 3.19x19 P2Y12 receptor 4PXZ - -
TM3 83 3.20x20 P2Y12 receptor 4PXZ P2Y12 receptor 4PXZ
TM3 84 3.21x21 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 85 3.22x22 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM3 86 3.23x23 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM3 87 3.24x24 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM3 88 3.25x25 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 89 3.26x26 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM3 90 3.27x27 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 91 3.28x28 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM3 92 3.29x29 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM3 93 3.30x30 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 94 3.31x31 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 95 3.32x32 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 96 3.33x33 M1 receptor 6OIJ OX1 receptor 6TO7
TM3 97 3.34x34 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM3 98 3.35x35 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 99 3.36x36 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM3 100 3.37x37 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 101 3.38x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 102 3.39x39 M1 receptor 6OIJ CCR9 5LWE
TM3 103 3.40x40 M1 receptor 6OIJ NOP receptor 5DHG
TM3 104 3.41x41 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 105 3.42x42 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 106 3.43x43 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM3 107 3.44x44 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM3 108 3.45x45 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 109 3.46x46 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM3 110 3.47x47 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 111 3.48x48 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM3 112 3.49x49 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 4XES
TM3 113 3.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 114 3.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 115 3.52x52 M1 receptor 6OIJ H1 receptor 3RZE
TM3 116 3.53x53 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM3 117 3.54x54 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 118 3.55x55 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM3 119 3.56x56 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
ICL2 120 - - - - -
ICL2 121 - - - - -
ICL2 122 - - - - -
ICL2 123 - - - - -
ICL2 124 - - - - -
TM4 125 4.38x38 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM4 126 4.39x39 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 127 4.40x40 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM4 128 4.41x41 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 129 4.42x42 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 130 4.43x43 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM4 131 4.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 132 4.45x45 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM4 133 4.46x46 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM4 134 4.47x47 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 135 4.48x48 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM4 136 4.49x49 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 137 4.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 138 4.51x51 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM4 139 4.52x52 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM4 140 4.53x53 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM4 141 4.54x54 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 142 4.55x55 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 143 4.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 144 4.57x57 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM4 145 4.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 146 4.59x59 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 147 4.60x60 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 148 4.61x61 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM4 149 4.62x62 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 150 4.63x63 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
ECL2 151 - - - - -
ECL2 152 - MT2 receptor 6ME6 - -
ECL2 153 - MT2 receptor 6ME6 - -
ECL2 154 - MT2 receptor 6ME6 - -
ECL2 155 - MT2 receptor 6ME6 - -
ECL2 156 - MT2 receptor 6ME6 MT2 receptor 6ME6
ECL2 157 - MT2 receptor 6ME6 - -
ECL2 158 - MT2 receptor 6ME6 - -
ECL2 159 - MT2 receptor 6ME6 - -
ECL2 160 - MT2 receptor 6ME6 - -
ECL2 161 - - - - -
ECL2 162 45.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 163 45.51x51 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
ECL2 164 45.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
ECL2 165 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 166 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 167 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 168 - M1 receptor 6OIJ - -
TM5 169 5.35x36 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 170 5.36x37 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 171 5.37x38 M1 receptor 6OIJ FFA1 receptor 5TZY
TM5 172 5.38x39 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 173 5.39x40 M1 receptor 6OIJ FFA1 receptor 5TZY
TM5 174 5.40x41 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 175 5.41x42 M1 receptor 6OIJ Y1 receptor 5ZBH
TM5 176 5.42x43 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 177 5.43x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 178 5.44x45 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 179 5.45x46 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 180 5.46x461 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 181 5.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 182 5.48x48 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM5 183 5.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 184 5.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 185 5.51x51 M1 receptor 6OIJ PAR2 5NDD
TM5 186 5.52x52 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM5 187 5.53x53 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 188 5.54x54 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 189 5.55x55 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM5 190 5.56x56 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM5 191 5.57x57 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 192 5.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 193 5.59x59 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 194 5.60x60 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM5 195 5.61x61 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 196 5.62x62 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 197 5.63x63 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 198 5.64x64 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 199 5.65x65 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 200 5.66x66 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 201 5.67x67 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 202 5.68x68 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 203 5.69x69 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 204 5.70x70 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 205 5.71x71 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 206 5.72x72 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 207 5.73x73 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 208 5.74x74 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 209 5.75x75 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 210 5.76x76 β2-adrenoceptor 3SN6 - -
ICL3 211 - - - - -
ICL3 212 - - - - -
ICL3 213 - - - - -
ICL3 214 - - - - -
ICL3 215 - - - - -
ICL3 225 - - - - -
ICL3 226 - - - - -
ICL3 227 - - - - -
ICL3 228 - - - - -
ICL3 229 - - - - -
TM6 230 6.24x24 OX1 receptor 6TO7 - -
TM6 231 6.25x25 OX1 receptor 6TO7 LPA1 receptor 4Z35
TM6 232 6.26x26 OX1 receptor 6TO7 - -
TM6 233 6.27x27 OX1 receptor 6TO7 AT2 receptor 6JOD
TM6 234 6.28x28 OX1 receptor 6TO7 β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 235 6.29x29 OX1 receptor 6TO7 P2Y1 receptor 4XNW
TM6 236 6.30x30 OX1 receptor 6TO7 - -
TM6 237 6.31x31 OX1 receptor 6TO7 US28 5WB1
TM6 238 6.32x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 239 6.33x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 240 6.34x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 241 6.35x35 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM6 242 6.36x36 M1 receptor 6OIJ CCR9 5LWE
TM6 243 6.37x37 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 244 6.38x38 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM6 245 6.39x39 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 246 6.40x40 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM6 247 6.41x41 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM6 248 6.42x42 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 249 6.43x43 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 250 6.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 251 6.45x45 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM6 252 6.46x46 M1 receptor 6OIJ S1P1 receptor 3V2Y
TM6 253 6.47x47 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 254 6.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 255 6.49x49 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 256 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 257 6.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 258 6.52x52 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 259 6.53x53 M1 receptor 6OIJ MT2 receptor 6ME6
TM6 260 6.54x54 M1 receptor 6OIJ P2Y12 receptor 4NTJ
TM6 261 6.55x55 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 262 6.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 263 6.57x57 M1 receptor 6OIJ MT2 receptor 6ME6
TM6 264 6.58x58 M1 receptor 6OIJ NK1 receptor 6HLP
ECL3 265 - - - - -
ECL3 266 - - - - -
ECL3 267 - - - - -
ECL3 268 - - - - -
ECL3 269 - - - - -
ECL3 270 - - - - -
ECL3 271 - - - - -
TM7 272 7.35x34 M1 receptor 6OIJ LPA1 receptor 4Z35
TM7 273 7.36x35 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM7 274 7.37x36 M1 receptor 6OIJ D3 receptor 3PBL
TM7 275 7.38x37 M1 receptor 6OIJ D4 receptor 5WIV
TM7 276 7.39x38 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM7 277 7.40x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 278 7.41x40 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM7 279 7.42x41 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM7 280 7.43x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 281 7.44x43 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM7 282 7.45x45 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM7 283 7.46x46 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 284 7.47x47 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 285 7.48x48 M1 receptor 6OIJ OX1 receptor 6TO7
TM7 286 7.49x49 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 287 7.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 288 7.51x51 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM7 289 7.52x52 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM7 290 7.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 291 7.54x54 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM7 292 7.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 293 7.56x56 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
H8 294 8.47x47 M1 receptor 6OIJ - -
H8 295 8.48x48 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 4UHR
H8 296 8.49x49 M1 receptor 6OIJ - -
H8 297 8.50x50 M1 receptor 6OIJ EP4 receptor 5YWY
H8 298 8.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
H8 299 8.52x52 M1 receptor 6OIJ NK1 receptor 6HLP
H8 300 8.53x53 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
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G-PROTEIN TEMPLATES

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