GPR52 - subunit alpha-11 complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNA11

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 38%) PDB: 6OIJ
subunit alpha-11 (sequence similarity: 100%)

RECEPTOR TEMPLATES

6OIJ (M1 receptor)
4IB4 (5-HT2B receptor)
6LI1 (GPR52)
6LI0 (GPR52)
4UHR (A2A receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 73.9 16.8 9.4
Side-chains 21.3 65.2 13.5

Number of backbone templates: 5
Number of rotamer templates: 30

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 35 - - - - -
N-term 36 - - - - -
N-term 37 - - - - -
N-term 38 - - - - -
N-term 39 - M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 40 1.32x32 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM1 41 1.33x33 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM1 42 1.34x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 43 1.35x35 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM1 44 1.36x36 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM1 45 1.37x37 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM1 46 1.38x38 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 47 1.39x39 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM1 48 1.40x40 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM1 49 1.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 50 1.42x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 51 1.43x43 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM1 52 1.44x44 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM1 53 1.45x45 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 54 1.46x46 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 55 1.47x47 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 56 1.48x48 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM1 57 1.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 58 1.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 59 1.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 60 1.52x52 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM1 61 1.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 62 1.54x54 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 63 1.55x55 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM1 64 1.56x56 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM1 65 1.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 66 1.58x58 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM1 67 1.59x59 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM1 68 1.60x60 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
ICL1 69 12.48x48 - - - -
ICL1 70 12.49x49 5-HT2B receptor 4IB4 GPR52 6LI3
ICL1 71 12.50x50 5-HT2B receptor 4IB4 5-HT2B receptor 4IB4
ICL1 72 12.51x51 - - - -
TM2 73 2.36x36 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 74 2.37x37 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 75 2.38x38 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 76 2.39x39 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 77 2.40x40 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM2 78 2.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 79 2.42x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 80 2.43x43 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 81 2.44x44 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM2 82 2.45x45 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM2 83 2.46x46 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM2 84 2.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 85 2.48x48 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM2 86 2.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 87 2.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 88 2.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 89 2.52x52 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM2 90 2.53x53 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 91 2.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 92 2.55x55 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 93 2.56x56 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM2 94 2.57x57 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM2 95 2.58x58 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM2 96 2.59x59 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6PWC
TM2 97 2.60x60 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM2 98 2.61x61 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 99 2.62x62 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 100 2.63x63 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM2 101 2.64x64 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 102 2.65x65 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 103 2.66x66 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM2 104 2.67x67 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI3
ECL1 105 - - - - -
ECL1 106 - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL1 107 - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL1 108 - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL1 109 - - - - -
TM3 110 3.21x21 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI0
TM3 111 3.22x22 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM3 112 3.23x23 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 113 3.24x24 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 114 3.25x25 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 115 3.26x26 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM3 116 3.27x27 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM3 117 3.28x28 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM3 118 3.29x29 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM3 119 3.30x30 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM3 120 3.31x31 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 121 3.32x32 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM3 122 3.33x33 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM3 123 3.34x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 124 3.35x35 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 125 3.36x36 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI3
TM3 126 3.37x37 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM3 127 3.38x38 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM3 128 3.39x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 129 3.40x40 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM3 130 3.41x41 M1 receptor 6OIJ LPA1 receptor 4Z35
TM3 131 3.42x42 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM3 132 3.43x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 133 3.44x44 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6PWC
TM3 134 3.45x45 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM3 135 3.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 136 3.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 137 3.48x48 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 138 3.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 139 3.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 140 3.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 141 3.52x52 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 142 3.53x53 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 143 3.54x54 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 144 3.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 145 3.56x56 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
ICL2 146 34.50x50 - - - -
ICL2 147 34.51x51 GPR52 6LI1 M1 receptor 6OIJ
ICL2 148 34.52x52 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ICL2 149 34.53x53 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ICL2 150 34.54x54 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ICL2 151 34.55x55 GPR52 6LI1 GPR52 6LI3
ICL2 152 34.56x56 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ICL2 153 34.57x57 - - - -
TM4 154 4.38x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 155 4.39x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 156 4.40x40 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM4 157 4.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 158 4.42x42 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM4 159 4.43x43 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 160 4.44x44 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 161 4.45x45 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM4 162 4.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 163 4.47x47 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM4 164 4.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 165 4.49x49 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM4 166 4.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 167 4.51x51 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 168 4.52x52 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM4 169 4.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 170 4.54x54 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM4 171 4.55x55 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 172 4.56x56 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 173 4.57x57 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM4 174 4.58x59 GPR52 6LI1 β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 175 4.59x60 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 176 4.60x61 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM4 177 4.61x62 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 178 4.62x63 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 179 - - - - -
ECL2 180 - GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 181 - GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 182 - GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 183 - GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 184 - GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 185 - GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 186 - GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 187 - GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 188 - GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 189 - GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 190 - GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
ECL2 191 - GPR52 6LI1 - -
ECL2 192 - - - - -
ECL2 193 45.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 194 45.51x51 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
ECL2 195 45.52x52 M1 receptor 6OIJ US28 4XT1
ECL2 196 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 197 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 198 - M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 199 - M1 receptor 6OIJ - -
TM5 200 5.36x37 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM5 201 5.37x38 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 202 5.38x39 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 203 5.39x40 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 204 5.40x41 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 205 5.41x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 206 5.42x43 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM5 207 5.43x44 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 208 5.44x45 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 209 5.45x46 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 210 5.46x461 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 211 5.47x47 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 212 5.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 213 5.49x49 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 214 5.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 215 5.51x51 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 216 5.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 217 5.53x53 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 218 5.54x54 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM5 219 5.55x55 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 220 5.56x56 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 221 5.57x57 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM5 222 5.58x58 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 223 5.59x59 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM5 224 5.60x60 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 225 5.61x61 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 226 5.62x62 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 227 5.63x63 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM5 228 5.64x64 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 229 5.65x65 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 230 5.66x66 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 231 5.67x67 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 232 5.68x68 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 233 5.69x69 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI3
TM5 234 5.70x70 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI3
TM5 235 5.71x71 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 236 5.72x72 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI3
TM5 237 5.73x73 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 238 5.74x74 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI3
ICL3 239 - - - - -
ICL3 240 - - - - -
ICL3 241 - - - - -
ICL3 242 - - - - -
ICL3 243 - - - - -
ICL3 246 - - - - -
ICL3 247 - - - - -
ICL3 248 - - - - -
ICL3 249 - - - - -
ICL3 250 - - - - -
TM6 251 6.21x21 A2A receptor 4UHR - -
TM6 252 6.22x22 A2A receptor 4UHR - -
TM6 253 6.23x23 A2A receptor 4UHR - -
TM6 254 6.24x24 A2A receptor 4UHR - -
TM6 255 6.25x25 A2A receptor 4UHR Rhodopsin 4ZWJ
TM6 256 6.26x26 A2A receptor 4UHR - -
TM6 257 6.27x27 A2A receptor 4UHR - -
TM6 258 6.28x28 A2A receptor 4UHR 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 259 6.29x29 A2A receptor 4UHR P2Y1 receptor 4XNW
TM6 260 6.30x30 A2A receptor 4UHR CB1 receptor 5XRA
TM6 261 6.31x31 A2A receptor 4UHR 5-HT2C receptor 6BQG
TM6 262 6.32x32 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 263 6.33x33 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI0
TM6 264 6.34x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 265 6.35x35 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM6 266 6.36x36 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 267 6.37x37 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 268 6.38x38 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM6 269 6.39x39 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM6 270 6.40x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 271 6.41x41 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM6 272 6.42x42 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM6 273 6.43x43 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM6 274 6.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 275 6.45x45 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM6 276 6.46x46 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM6 277 6.47x47 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM6 278 6.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 279 6.49x49 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 280 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 281 6.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 282 6.52x52 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM6 283 6.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 284 6.54x54 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM6 285 6.55x55 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM6 286 6.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 287 6.57x57 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM6 288 6.58x58 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI3
TM6 289 6.59x59 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM6 290 6.60x60 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI0
TM6 291 6.61x61 M1 receptor 6OIJ TP receptor 6IIV
ECL3 292 - - - - -
ECL3 293 - GPR52 6LI0 GPR52 6LI0
ECL3 294 - - - - -
TM7 295 7.31x30 GPR52 6LI1 GPR52 6LI1
TM7 296 7.32x31 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM7 297 7.33x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 298 7.34x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 299 7.35x34 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM7 300 7.36x35 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM7 301 7.37x36 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 302 7.38x37 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM7 303 7.39x38 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM7 304 7.40x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 305 7.41x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 306 7.42x41 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM7 307 7.43x42 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM7 308 7.44x43 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM7 309 7.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 310 7.46x46 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM7 311 7.47x47 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
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G-PROTEIN TEMPLATES

Segment Seq.num. CGN# Backbone PDB Rotamer PDB
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