GPR26 - subunit alpha-15 complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNA15

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 41%) PDB: 6OIJ
subunit alpha-11 (sequence similarity: 71%)

RECEPTOR TEMPLATES

5ZKC (M2 receptor)
6OIJ (M1 receptor)
6CM4 (D2 receptor)
5ZKQ (PAF receptor)
5WQC (OX2 receptor)
5WS3 (OX2 receptor)
6DDF (μ receptor)
3VW7 (PAR1)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
6OL9 (M5 receptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 76.5 14.1 9.5
Side-chains 18.0 57.5 24.5

Number of backbone templates: 10
Number of rotamer templates: 57

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 1 - - - - -
TM1 2 1.29x29 M2 receptor 5ZKC AT1 receptor 6OS2
TM1 3 1.30x30 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM1 4 1.31x31 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 5 1.32x32 M1 receptor 6OIJ C5a1 receptor 5O9H
TM1 6 1.33x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 7 1.34x34 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 8 1.35x35 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 9 1.36x36 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 10 1.37x37 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 11 1.38x38 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 12 1.39x39 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 13 1.40x40 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 14 1.41x41 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM1 15 1.42x42 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM1 16 1.43x43 M1 receptor 6OIJ BLT1 receptor 5X33
TM1 17 1.44x44 M1 receptor 6OIJ D4 receptor 5WIV
TM1 18 1.45x45 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM1 19 1.46x46 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 20 1.47x47 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM1 21 1.48x48 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 22 1.49x49 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 23 1.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 24 1.51x51 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM1 25 1.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 26 1.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 27 1.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 28 1.55x55 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 29 1.56x56 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 30 1.57x57 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6UP7
TM1 31 1.58x58 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM1 32 1.59x59 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM1 33 1.60x60 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6KPG
ICL1 34 12.48x48 - - - -
ICL1 35 12.49x49 D2 receptor 6CM4 - -
ICL1 36 12.50x50 D2 receptor 6CM4 - -
ICL1 37 12.51x51 - - - -
TM2 38 2.36x36 PAF receptor 5ZKQ CB2 receptor 6KPF
TM2 39 2.37x37 PAF receptor 5ZKQ - -
TM2 40 2.38x38 PAF receptor 5ZKQ A1 receptor 6D9H
TM2 41 2.39x39 M1 receptor 6OIJ ETB receptor 5X93
TM2 42 2.40x40 M1 receptor 6OIJ BLT1 receptor 5X33
TM2 43 2.41x41 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM2 44 2.42x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 45 2.43x43 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 46 2.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 47 2.45x45 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM2 48 2.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 49 2.47x47 M1 receptor 6OIJ PAF receptor 5ZKQ
TM2 50 2.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 51 2.49x49 M1 receptor 6OIJ ETB receptor 5X93
TM2 52 2.50x50 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5WF5
TM2 53 2.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 54 2.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 55 2.53x53 M1 receptor 6OIJ CysLT1 receptor 6RZ4
TM2 56 2.54x54 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM2 57 2.55x55 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM2 58 2.56x551 M1 receptor 6OIJ H1 receptor 3RZE
TM2 59 2.57x56 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 60 2.58x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 61 2.59x58 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 62 2.60x59 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 63 2.61x60 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM2 64 2.62x61 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 65 2.63x62 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 66 2.64x63 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 67 2.65x64 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 68 2.66x65 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM2 69 2.67x66 M1 receptor 6OIJ CXCR4 3ODU
TM2 70 2.68x67 M1 receptor 6OIJ PAF receptor 5ZKQ
ECL1 71 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL1 72 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL1 73 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL1 74 - M1 receptor 6OIJ - -
TM3 75 3.21x21 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 76 3.22x22 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM3 77 3.23x23 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM3 78 3.24x24 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM3 79 3.25x25 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 80 3.26x26 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM3 81 3.27x27 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 82 3.28x28 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM3 83 3.29x29 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 84 3.30x30 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 85 3.31x31 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 86 3.32x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 87 3.33x33 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM3 88 3.34x34 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM3 89 3.35x35 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 90 3.36x36 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 5N2S
TM3 91 3.37x37 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 4UHR
TM3 92 3.38x38 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 93 3.39x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 94 3.40x40 M1 receptor 6OIJ CCR7 6QZH
TM3 95 3.41x41 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 96 3.42x42 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 97 3.43x43 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM3 98 3.44x44 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6PWC
TM3 99 3.45x45 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 100 3.46x46 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM3 101 3.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 102 3.48x48 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 103 3.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 104 3.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 105 3.51x51 M1 receptor 6OIJ OX2 receptor 5WS3
TM3 106 3.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM3 107 3.53x53 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 108 3.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 109 3.55x55 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM3 110 3.56x56 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
ICL2 111 34.50x50 - - - -
ICL2 112 34.51x51 M2 receptor 5ZKC M2 receptor 5ZKC
ICL2 113 34.52x52 M2 receptor 5ZKC M1 receptor 6OIJ
ICL2 114 34.53x53 M2 receptor 5ZKC M2 receptor 5ZKC
ICL2 115 34.54x54 M2 receptor 5ZKC M1 receptor 6OIJ
ICL2 116 34.55x55 M2 receptor 5ZKC M1 receptor 6OIJ
ICL2 117 34.56x56 M2 receptor 5ZKC M2 receptor 5ZKC
ICL2 118 34.57x57 - - - -
TM4 119 4.38x38 M1 receptor 6OIJ FFA1 receptor 5TZY
TM4 120 4.39x39 M1 receptor 6OIJ CXCR4 3ODU
TM4 121 4.40x40 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 122 4.41x41 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 123 4.42x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 124 4.43x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 125 4.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 126 4.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 127 4.46x46 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM4 128 4.47x47 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM4 129 4.48x48 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 130 4.49x49 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM4 131 4.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 132 4.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 133 4.52x52 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 134 4.53x53 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM4 135 4.54x54 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM4 136 4.55x55 M1 receptor 6OIJ D2 receptor 6CM4
TM4 137 4.56x56 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM4 138 4.57x57 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 139 4.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 140 4.59x59 M1 receptor 6OIJ D4 receptor 5WIV
TM4 141 4.60x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 142 4.61x61 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM4 143 4.62x62 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
ECL2 144 - - - - -
ECL2 145 - OX2 receptor 5WQC - -
ECL2 146 - OX2 receptor 5WQC - -
ECL2 147 - OX2 receptor 5WQC - -
ECL2 148 - OX2 receptor 5WQC - -
ECL2 149 - OX2 receptor 5WQC OX2 receptor 5WQC
ECL2 150 - OX2 receptor 5WQC - -
ECL2 151 - - - - -
ECL2 152 - - - - -
ECL2 153 - - - - -
ECL2 154 - OX2 receptor 5WQC - -
ECL2 155 - OX2 receptor 5WQC - -
ECL2 156 - OX2 receptor 5WQC - -
ECL2 157 - OX2 receptor 5WQC OX2 receptor 5WQC
ECL2 158 - - - - -
ECL2 159 45.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 160 45.51x51 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
ECL2 161 45.52x52 M1 receptor 6OIJ CXCR4 3ODU
ECL2 162 - - - - -
ECL2 163 - μ receptor 6DDF - -
ECL2 164 - μ receptor 6DDF - -
ECL2 165 - μ receptor 6DDF - -
ECL2 166 - μ receptor 6DDF - -
ECL2 167 - μ receptor 6DDF - -
ECL2 168 - - - - -
TM5 169 5.35x35 OX2 receptor 5WS3 - -
TM5 170 5.36x36 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 171 5.37x37 M1 receptor 6OIJ apelin receptor 5VBL
TM5 172 5.38x38 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM5 173 5.39x39 M1 receptor 6OIJ δ receptor 4N6H
TM5 174 5.40x40 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 175 5.41x41 M1 receptor 6OIJ MT2 receptor 6ME6
TM5 176 5.42x42 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 177 5.43x43 M1 receptor 6OIJ CXCR4 3ODU
TM5 178 5.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 179 5.45x45 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 180 5.46x46 PAR1 3VW7 PAF receptor 5ZKQ
TM5 181 5.47x47 PAR1 3VW7 PAR1 3VW7
TM5 182 5.48x48 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 183 5.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 184 5.50x50 M1 receptor 6OIJ TP receptor 6IIV
TM5 185 5.51x51 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 186 5.52x52 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 187 5.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 188 5.54x54 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 189 5.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 190 5.56x56 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM5 191 5.57x57 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 192 5.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 193 5.59x59 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 194 5.60x60 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM5 195 5.61x61 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 196 5.62x62 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 197 5.63x63 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 198 5.64x64 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 199 5.65x65 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 200 5.66x66 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 201 5.67x67 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 202 5.68x68 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 203 5.69x69 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM5 204 5.70x70 M1 receptor 6OIJ D2 receptor 6LUQ
TM5 205 5.71x71 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 206 5.72x72 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 207 5.73x73 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 208 5.74x74 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 209 5.75x75 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 210 5.76x76 β2-adrenoceptor 3SN6 - -
ICL3 211 - - - - -
ICL3 212 - - - - -
ICL3 213 - - - - -
ICL3 214 - - - - -
ICL3 215 - - - - -
ICL3 225 - - - - -
ICL3 226 - - - - -
ICL3 227 - - - - -
ICL3 228 - - - - -
ICL3 229 - - - - -
TM6 230 6.24x24 M5 receptor 6OL9 - -
TM6 231 6.25x25 M5 receptor 6OL9 μ receptor 6DDF
TM6 232 6.26x26 M5 receptor 6OL9 OX2 receptor 5WS3
TM6 233 6.27x27 M5 receptor 6OL9 - -
TM6 234 6.28x28 M5 receptor 6OL9 μ receptor 6DDF
TM6 235 6.29x29 M5 receptor 6OL9 5-HT1B receptor 6G79
TM6 236 6.30x30 M5 receptor 6OL9 AT2 receptor 6JOD
TM6 237 6.31x31 M5 receptor 6OL9 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 238 6.32x32 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM6 239 6.33x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 240 6.34x34 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM6 241 6.35x35 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 242 6.36x36 M1 receptor 6OIJ PAR2 5NDD
TM6 243 6.37x37 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM6 244 6.38x38 M1 receptor 6OIJ M5 receptor 6OL9
TM6 245 6.39x39 M1 receptor 6OIJ CCR5 5UIW
TM6 246 6.40x40 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 247 6.41x41 M1 receptor 6OIJ CXCR4 3ODU
TM6 248 6.42x42 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 249 6.43x43 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 250 6.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 251 6.45x45 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 252 6.46x46 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM6 253 6.47x47 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 254 6.48x48 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM6 255 6.49x49 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM6 256 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 257 6.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 258 6.52x52 M1 receptor 6OIJ EP4 receptor 5YWY
TM6 259 6.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 260 6.54x54 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 261 6.55x55 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM6 262 6.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 263 6.57x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 264 6.58x58 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6VI4
TM6 265 6.59x59 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 266 6.60x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 267 6.61x61 M1 receptor 6OIJ - -
ECL3 268 - - - - -
ECL3 269 - D2 receptor 6CM4 - -
ECL3 270 - D2 receptor 6CM4 - -
ECL3 271 - - - - -
TM7 272 7.31x30 D2 receptor 6CM4 Rhodopsin 4ZWJ
TM7 273 7.32x31 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 274 7.33x32 M1 receptor 6OIJ H1 receptor 3RZE
TM7 275 7.34x33 M1 receptor 6OIJ OX2 receptor 5WS3
TM7 276 7.35x34 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 277 7.36x35 M1 receptor 6OIJ MT1 receptor 6ME2
TM7 278 7.37x36 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 279 7.38x37 M1 receptor 6OIJ OX2 receptor 5WS3
TM7 280 7.39x38 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 281 7.40x39 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM7 282 7.41x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 283 7.42x41 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM7 284 7.43x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 285 7.44x43 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM7 286 7.45x45 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 287 7.46x46 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM7 288 7.47x47 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 289 7.48x48 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 290 7.49x49 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM7 291 7.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 292 7.51x51 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM7 293 7.52x52 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 294 7.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 295 7.54x54 M1 receptor 6OIJ LPA1 receptor 4Z35
TM7 296 7.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 297 7.56x56 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
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H8 310 8.59x59 D2 receptor 6CM4 A1 receptor 5UEN
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G-PROTEIN TEMPLATES

Segment Seq.num. CGN# Backbone PDB Rotamer PDB
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