GPR1 - G(k) subunit alpha complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAI3

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 56%) PDB: 6OMM
G(i) subunit alpha-1 (sequence similarity: 98%)

RECEPTOR TEMPLATES

6LW5 (FPR2/ALX)
6OMM (FPR2/ALX)
5C1M (μ receptor)
4YAY (AT1 receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 87.6 7.0 5.4
Side-chains 29.8 50.5 19.7

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 39

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 26 - FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
N-term 27 - FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
N-term 28 - FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
N-term 29 - FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
N-term 30 - FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
TM1 31 1.25x25 FPR2/ALX 6LW5 - -
TM1 32 1.26x26 FPR2/ALX 6LW5 - -
TM1 33 1.27x27 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 34 1.28x28 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 35 1.29x29 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM1 36 1.30x30 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 37 1.31x31 FPR2/ALX 6OMM MT2 receptor 6ME6
TM1 38 1.32x32 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 39 1.33x33 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM1 40 1.34x34 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 41 1.35x35 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2A receptor 6A94
TM1 42 1.36x36 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 43 1.37x37 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 44 1.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 45 1.39x39 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 46 1.40x40 FPR2/ALX 6OMM ETB receptor 5X93
TM1 47 1.41x41 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM1 48 1.42x42 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM1 49 1.43x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 50 1.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 51 1.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 52 1.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 53 1.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 54 1.48x48 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM1 55 1.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 56 1.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 57 1.51x51 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM1 58 1.52x52 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 59 1.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 60 1.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 61 1.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 62 1.56x56 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 63 1.57x57 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM1 64 1.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 65 1.59x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 66 1.60x60 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM1 67 1.61x61 FPR2/ALX 6OMM - -
ICL1 68 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL1 69 - FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 70 2.37x37 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 71 2.38x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 72 2.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 73 2.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 74 2.41x41 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM2 75 2.42x42 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
TM2 76 2.43x43 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 77 2.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 78 2.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 79 2.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 80 2.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 81 2.48x48 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM2 82 2.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 83 2.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 84 2.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 85 2.52x52 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM2 86 2.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 87 2.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 88 2.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 89 2.56x56 FPR2/ALX 6OMM NK1 receptor 6HLP
TM2 90 2.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 91 2.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 92 2.59x59 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 93 2.60x60 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM2 94 2.61x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 95 2.62x62 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM2 96 2.63x63 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 97 2.64x64 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 98 2.65x65 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 99 2.66x66 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 100 2.67x67 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
ECL1 101 - - - - -
ECL1 102 23.49x49 FPR2/ALX 6LW5 M1 receptor 6OIJ
ECL1 103 23.50x50 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ECL1 104 23.51x51 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ECL1 105 23.52x52 - - - -
TM3 106 3.21x21 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 107 3.22x22 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 108 3.23x23 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 109 3.24x24 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 110 3.25x25 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 111 3.26x26 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 112 3.27x27 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 113 3.28x28 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM3 114 3.29x29 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 115 3.30x30 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM3 116 3.31x31 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM3 117 3.32x32 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM3 118 3.33x33 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 119 3.34x34 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 120 3.35x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 121 3.36x36 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM3 122 3.37x37 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 123 3.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 124 3.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 125 3.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 126 3.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 127 3.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 128 3.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 129 3.44x44 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 130 3.45x45 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM3 131 3.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 132 3.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 133 3.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 134 3.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 135 3.50x50 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 136 3.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 137 3.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 138 3.53x53 FPR2/ALX 6OMM - -
TM3 139 3.54x54 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM3 140 3.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 141 3.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ICL2 142 34.50x50 - - - -
ICL2 143 34.51x51 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ICL2 144 34.52x52 FPR2/ALX 6LW5 BLT1 receptor 5X33
ICL2 145 34.53x53 FPR2/ALX 6LW5 AT1 receptor 6OS2
ICL2 146 34.54x54 FPR2/ALX 6LW5 CCR9 5LWE
ICL2 147 34.55x55 FPR2/ALX 6LW5 Rhodopsin 4ZWJ
ICL2 148 34.56x56 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ICL2 149 34.57x57 - - - -
TM4 150 4.38x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 151 4.39x39 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3ODU
TM4 152 4.40x40 FPR2/ALX 6OMM US28 4XT1
TM4 153 4.41x41 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM4 154 4.42x42 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM4 155 4.43x43 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM4 156 4.44x44 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM4 157 4.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 158 4.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 159 4.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 160 4.48x48 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM4 161 4.49x49 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 162 4.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 163 4.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 164 4.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 165 4.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 166 4.54x54 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM4 167 4.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 168 4.56x56 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM4 169 4.57x57 μ receptor 5C1M μ receptor 5C1M
TM4 170 4.58x58 μ receptor 5C1M S1P1 receptor 3V2Y
TM4 171 4.59x59 μ receptor 5C1M μ receptor 5C1M
TM4 172 4.60x60 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM4 173 4.61x61 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM4 174 4.62x62 FPR2/ALX 6OMM PAR2 5NDD
TM4 175 4.63x63 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM4 176 4.64x64 FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 177 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 178 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 179 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 180 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 181 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 182 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 183 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 184 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 185 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 186 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 187 45.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 188 45.51x51 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
ECL2 189 45.52x52 FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 190 - - - - -
TM5 191 5.23x24 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 192 5.24x25 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 193 5.25x26 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 194 5.26x27 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 195 5.27x28 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 196 5.28x29 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 197 5.29x30 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 198 5.30x31 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 199 5.31x32 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM5 200 5.32x33 FPR2/ALX 6OMM P2Y1 receptor 4XNW
TM5 201 5.33x34 FPR2/ALX 6OMM OX2 receptor 5WS3
TM5 202 5.34x35 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
TM5 203 5.35x36 FPR2/ALX 6OMM P2Y12 receptor 4NTJ
TM5 204 5.36x37 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 205 5.37x38 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM5 206 5.38x39 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 207 5.39x40 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM5 208 5.40x41 FPR2/ALX 6OMM ETB receptor 5X93
TM5 209 5.41x42 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM5 210 5.42x43 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 211 5.43x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 212 5.44x45 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM5 213 5.45x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 214 5.46x461 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 215 5.47x47 FPR2/ALX 6OMM OX2 receptor 5WS3
TM5 216 5.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6LW5
TM5 217 5.49x49 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 218 5.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 219 5.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 220 5.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 221 5.53x53 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
TM5 222 5.54x54 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 223 5.55x55 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM5 224 5.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 225 5.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 226 5.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 227 5.59x59 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM5 228 5.60x60 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 229 5.61x61 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM5 230 5.62x62 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM5 231 5.63x63 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM5 232 5.64x64 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 233 5.65x65 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM5 234 5.66x66 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 235 5.67x67 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 236 5.68x68 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
ICL3 237 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 238 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ICL3 239 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 240 - FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 241 6.30x30 AT1 receptor 4YAY C5a1 receptor 6C1R
TM6 242 6.31x31 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 243 6.32x32 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 244 6.33x33 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 245 6.34x34 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 246 6.35x35 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 247 6.36x36 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 248 6.37x37 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 249 6.38x38 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM6 250 6.39x39 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM6 251 6.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 252 6.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 253 6.42x42 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 254 6.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 255 6.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 256 6.45x45 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 257 6.46x46 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM6 258 6.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 259 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 260 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM6 261 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 262 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 263 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM6 264 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 265 6.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 266 6.55x55 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM6 267 6.56x56 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM6 268 6.57x57 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 269 6.58x58 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM6 270 6.59x59 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM6 271 6.60x60 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM6 272 6.61x61 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
ECL3 273 - - - - -
ECL3 274 - - - - -
ECL3 275 - - - - -
ECL3 276 - - - - -
ECL3 277 - - - - -
ECL3 278 - - - - -
TM7 279 7.28x27 FPR2/ALX 6LW5 PAF receptor 5ZKQ
TM7 280 7.29x28 FPR2/ALX 6OMM - -
TM7 281 7.30x29 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
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G-PROTEIN TEMPLATES

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