GPR160 - G(q) subunit alpha complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAQ

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 27%) PDB: 6OIJ
subunit alpha-11 (sequence similarity: 96%)

RECEPTOR TEMPLATES

4NTJ (P2Y12 receptor)
4PXZ (P2Y12 receptor)
6OIJ (M1 receptor)
3VW7 (PAR1)
1GZM (Rhodopsin)
5ZKC (M2 receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 80.8 13.0 6.2
Side-chains 14.6 48.7 36.7

Number of backbone templates: 6
Number of rotamer templates: 44

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 12 - P2Y12 receptor 4NTJ P2Y12 receptor 4NTJ
N-term 13 - P2Y12 receptor 4NTJ P2Y12 receptor 4NTJ
N-term 14 - P2Y12 receptor 4NTJ P2Y12 receptor 4NTJ
N-term 15 - P2Y12 receptor 4NTJ P2Y12 receptor 4NTJ
N-term 16 - P2Y12 receptor 4NTJ P2Y12 receptor 4NTJ
TM1 17 1.28x28 P2Y12 receptor 4NTJ - -
TM1 18 1.29x29 P2Y12 receptor 4NTJ M2 receptor 4MQT
TM1 19 1.30x30 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 20 1.31x31 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM1 21 1.32x32 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM1 22 1.33x33 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM1 23 1.34x34 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 24 1.35x35 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM1 25 1.36x36 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 26 1.37x37 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 27 1.38x38 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 28 1.39x39 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 29 1.40x40 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM1 30 1.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 31 1.42x42 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 32 1.43x43 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM1 33 1.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 34 1.45x45 M1 receptor 6OIJ NOP receptor 5DHG
TM1 35 1.46x46 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 36 1.47x47 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM1 37 1.48x48 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM1 38 1.49x49 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM1 39 1.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 40 1.51x51 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM1 41 1.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 42 1.53x53 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM1 43 1.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 44 1.55x55 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 45 1.56x56 M1 receptor 6OIJ P2Y1 receptor 4XNW
TM1 46 1.57x57 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 47 1.58x58 M1 receptor 6OIJ H1 receptor 3RZE
TM1 48 1.59x59 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 49 1.60x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL1 50 - - - - -
ICL1 51 - P2Y12 receptor 4NTJ - -
ICL1 52 - - - - -
TM2 53 2.37x37 P2Y12 receptor 4NTJ LPA6 receptor 5XSZ
TM2 54 2.38x38 P2Y12 receptor 4NTJ - -
TM2 55 2.39x39 M1 receptor 6OIJ S1P1 receptor 3V2Y
TM2 56 2.40x40 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 57 2.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 58 2.42x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 59 2.43x43 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 60 2.44x44 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM2 61 2.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 62 2.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 63 2.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 64 2.48x48 M1 receptor 6OIJ NK1 receptor 6HLP
TM2 65 2.49x49 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 66 2.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 67 2.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 68 2.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 69 2.53x53 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM2 70 2.54x54 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM2 71 2.55x55 P2Y12 receptor 4NTJ M2 receptor 4MQT
TM2 72 2.56x56 P2Y12 receptor 4NTJ - -
TM2 73 2.57x57 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 74 2.58x58 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 75 2.59x59 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 76 2.60x60 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 5DYS
TM2 77 2.61x61 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM2 78 2.62x62 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM2 79 2.63x63 M1 receptor 6OIJ BLT1 receptor 5X33
TM2 80 2.64x64 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 81 2.65x65 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 82 2.66x66 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 4NC3
ECL1 83 - - - - -
ECL1 84 - - - - -
ECL1 85 - - - - -
ECL1 86 - - - - -
ECL1 87 - - - - -
TM3 88 3.18x18 P2Y12 receptor 4PXZ - -
TM3 89 3.19x19 P2Y12 receptor 4PXZ - -
TM3 90 3.20x20 P2Y12 receptor 4PXZ - -
TM3 91 3.21x21 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 92 3.22x22 M1 receptor 6OIJ MT1 receptor 6ME2
TM3 93 3.23x23 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 94 3.24x24 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 95 3.25x25 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 96 3.26x26 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 97 3.27x27 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 98 3.28x28 M1 receptor 6OIJ P2Y12 receptor 4NTJ
TM3 99 3.29x29 M1 receptor 6OIJ LPA1 receptor 4Z35
TM3 100 3.30x30 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM3 101 3.31x31 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 102 3.32x32 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 103 3.33x33 M1 receptor 6OIJ PAF receptor 5ZKQ
TM3 104 3.34x34 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM3 105 3.35x35 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 106 3.36x36 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM3 107 3.37x37 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM3 108 3.38x38 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 109 3.39x39 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 110 3.40x40 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 111 3.41x41 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 112 3.42x42 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 113 3.43x43 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 114 3.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 115 3.45x45 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM3 116 3.46x46 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM3 117 3.47x47 M1 receptor 6OIJ H1 receptor 3RZE
TM3 118 3.48x48 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM3 119 3.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 120 3.50x50 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 121 3.51x51 M1 receptor 6OIJ FPR2/ALX 6LW5
TM3 122 3.52x52 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM3 123 3.53x53 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 124 3.54x54 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 125 3.55x55 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 126 3.56x56 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
ICL2 127 - M1 receptor 6OIJ - -
ICL2 128 - M1 receptor 6OIJ - -
ICL2 129 - M1 receptor 6OIJ - -
ICL2 130 - M1 receptor 6OIJ - -
ICL2 131 - M1 receptor 6OIJ - -
ICL2 132 - M1 receptor 6OIJ - -
ICL2 133 - M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL2 134 - M1 receptor 6OIJ - -
TM4 135 4.38x38 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 136 4.39x39 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 137 4.40x40 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM4 138 4.41x41 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM4 139 4.42x42 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 140 4.43x43 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 141 4.44x44 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM4 142 4.45x45 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM4 143 4.46x46 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM4 144 4.47x47 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM4 145 4.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 146 4.49x49 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM4 147 4.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 148 4.51x51 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 149 4.52x52 M1 receptor 6OIJ EP4 receptor 5YWY
TM4 150 4.53x53 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM4 151 4.54x54 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM4 152 4.55x55 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM4 153 4.56x56 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 154 4.57x57 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM4 155 4.58x58 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM4 156 4.59x59 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 157 4.60x60 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 158 4.61x61 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 159 4.62x62 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM4 160 4.63x63 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
ECL2 161 - - - - -
ECL2 162 - PAR1 3VW7 PAR1 3VW7
ECL2 163 - PAR1 3VW7 - -
ECL2 164 - PAR1 3VW7 - -
ECL2 165 - PAR1 3VW7 - -
ECL2 166 - PAR1 3VW7 - -
ECL2 167 - PAR1 3VW7 - -
ECL2 168 - PAR1 3VW7 - -
ECL2 169 - PAR1 3VW7 - -
ECL2 170 - PAR1 3VW7 - -
ECL2 171 - PAR1 3VW7 - -
ECL2 172 - PAR1 3VW7 - -
ECL2 173 - - - - -
ECL2 174 45.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 175 45.51x51 M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 176 45.52x52 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 4LDE
ECL2 177 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 178 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 179 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 180 - M1 receptor 6OIJ - -
TM5 181 5.35x35 P2Y12 receptor 4NTJ - -
TM5 182 5.36x36 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 183 5.37x37 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM5 184 5.38x38 M1 receptor 6OIJ H1 receptor 3RZE
TM5 185 5.39x39 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 186 5.40x40 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM5 187 5.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 188 5.42x42 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 189 5.43x43 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM5 190 5.44x44 M1 receptor 6OIJ PAF receptor 5ZKQ
TM5 191 5.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 5CXV
TM5 192 5.46x46 P2Y12 receptor 4NTJ P2Y12 receptor 4NTJ
TM5 193 5.47x47 P2Y12 receptor 4NTJ CCR5 5UIW
TM5 194 5.48x48 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 195 5.49x49 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 196 5.50x50 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM5 197 5.51x51 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 198 5.52x52 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM5 199 5.53x53 M1 receptor 6OIJ CysLT2 receptor 6RZ6
TM5 200 5.54x54 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 201 5.55x55 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 202 5.56x56 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 203 5.57x57 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 204 5.58x58 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 205 5.59x59 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM5 206 5.60x60 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 207 5.61x61 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM5 208 5.62x62 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM5 209 5.63x63 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 210 5.64x64 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM5 211 5.65x65 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 212 5.66x66 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 213 5.67x67 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 214 5.68x68 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM5 215 5.69x69 M1 receptor 6OIJ CysLT1 receptor 6RZ4
TM5 216 5.70x70 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 217 5.71x71 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 218 5.72x72 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 219 5.73x73 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 4UHR
ICL3 220 - - - - -
ICL3 221 - - - - -
ICL3 222 - - - - -
ICL3 223 - - - - -
ICL3 224 - - - - -
ICL3 225 - - - - -
ICL3 226 - - - - -
ICL3 227 - - - - -
TM6 228 6.24x24 Rhodopsin 1GZM - -
TM6 229 6.25x25 Rhodopsin 1GZM - -
TM6 230 6.26x26 Rhodopsin 1GZM 5-HT2A receptor 6A94
TM6 231 6.27x27 Rhodopsin 1GZM PAR2 5NDD
TM6 232 6.28x28 Rhodopsin 1GZM - -
TM6 233 6.29x29 Rhodopsin 1GZM AT2 receptor 6JOD
TM6 234 6.30x30 Rhodopsin 1GZM - -
TM6 235 6.31x31 Rhodopsin 1GZM NTS1 receptor 5T04
TM6 236 6.32x32 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM6 237 6.33x33 M1 receptor 6OIJ P2Y1 receptor 4XNW
TM6 238 6.34x34 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 239 6.35x35 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM6 240 6.36x36 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM6 241 6.37x37 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 242 6.38x38 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM6 243 6.39x39 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 244 6.40x40 M1 receptor 6OIJ ETB receptor 5X93
TM6 245 6.41x41 M1 receptor 6OIJ P2Y12 receptor 4NTJ
TM6 246 6.42x42 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM6 247 6.43x43 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM6 248 6.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 249 6.45x45 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM6 250 6.46x46 M1 receptor 6OIJ TP receptor 6IIV
TM6 251 6.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 252 6.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 253 6.49x49 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 5DYS
TM6 254 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 255 6.51x51 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 256 6.52x52 M1 receptor 6OIJ EP4 receptor 5YWY
TM6 257 6.53x53 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM6 258 6.54x54 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM6 259 6.55x55 M1 receptor 6OIJ PAF receptor 5ZKQ
TM6 260 6.56x56 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM6 261 6.57x57 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM6 262 6.58x58 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM6 263 6.59x59 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM6 264 6.60x60 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 265 6.61x61 M1 receptor 6OIJ ETB receptor 5XPR
ECL3 266 - - - - -
ECL3 267 - M2 receptor 5ZKC - -
ECL3 268 - M2 receptor 5ZKC - -
ECL3 269 - - - - -
TM7 270 7.31x30 P2Y12 receptor 4NTJ - -
TM7 271 7.32x31 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 272 7.33x32 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM7 273 7.34x33 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM7 274 7.35x34 M1 receptor 6OIJ LPA1 receptor 4Z35
TM7 275 7.36x35 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM7 276 7.37x36 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 277 7.38x37 M1 receptor 6OIJ NK1 receptor 6HLP
TM7 278 7.39x38 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 279 7.40x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 280 7.41x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 281 7.42x41 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 282 7.43x42 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM7 283 7.44x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 284 7.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 285 7.46x46 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM7 286 7.47x47 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM7 287 7.48x48 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM7 288 7.49x49 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 289 7.50x50 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 290 7.51x51 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 291 7.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM7 292 7.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 293 7.54x54 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 294 7.55x55 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM7 295 7.56x56 M1 receptor 6OIJ - -
H8 296 8.47x47 M1 receptor 6OIJ P2Y12 receptor 4NTJ
H8 297 8.48x48 M1 receptor 6OIJ PAR2 5NDD
H8 298 8.49x49 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
H8 299 8.50x50 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
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G-PROTEIN TEMPLATES

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