GPR135 - G(q) subunit alpha complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAQ

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 34%) PDB: 6OIJ
subunit alpha-11 (sequence similarity: 96%)

RECEPTOR TEMPLATES

6ME2 (MT1 receptor)
6OIJ (M1 receptor)
4PXZ (P2Y12 receptor)
5ZBH (Y1 receptor)
4S0V (OX2 receptor)
5VBL (apelin receptor)
4UHR (A2A receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 72.4 13.8 13.8
Side-chains 17.2 52.4 30.4

Number of backbone templates: 7
Number of rotamer templates: 46

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 94 - - - - -
N-term 95 - - - - -
N-term 96 - - - - -
N-term 97 - - - - -
N-term 98 - - - - -
TM1 99 1.28x28 MT1 receptor 6ME2 AT1 receptor 6OS1
TM1 100 1.29x29 MT1 receptor 6ME2 CB2 receptor 6KPF
TM1 101 1.30x30 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 102 1.31x31 M1 receptor 6OIJ CCR9 5LWE
TM1 103 1.32x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 104 1.33x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 105 1.34x34 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM1 106 1.35x35 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 107 1.36x36 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 108 1.37x37 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM1 109 1.38x38 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 110 1.39x39 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM1 111 1.40x40 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM1 112 1.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 113 1.42x42 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 114 1.43x43 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM1 115 1.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 116 1.45x45 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM1 117 1.46x46 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 118 1.47x47 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM1 119 1.48x48 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM1 120 1.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 121 1.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 122 1.51x51 M1 receptor 6OIJ NOP receptor 5DHG
TM1 123 1.52x52 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM1 124 1.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 125 1.54x54 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM1 126 1.55x55 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 127 1.56x56 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM1 128 1.57x57 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM1 129 1.58x58 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM1 130 1.59x59 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM1 131 1.60x60 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
ICL1 132 12.48x48 - - - -
ICL1 133 12.49x49 MT1 receptor 6ME2 CB2 receptor 6KPF
ICL1 134 12.50x50 MT1 receptor 6ME2 MT1 receptor 6ME2
ICL1 135 12.51x51 - - - -
TM2 136 2.37x37 MT1 receptor 6ME2 5-HT1B receptor 6G79
TM2 137 2.38x38 MT1 receptor 6ME2 β2-adrenoceptor 3SN6
TM2 138 2.39x39 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 139 2.40x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 140 2.41x41 M1 receptor 6OIJ - -
TM2 141 2.42x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 142 2.43x43 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM2 143 2.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 144 2.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 145 2.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 146 2.47x47 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM2 147 2.48x48 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM2 148 2.49x49 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM2 149 2.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 150 2.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 151 2.52x52 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 152 2.53x53 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6PWC
TM2 153 2.54x54 M1 receptor 6OIJ MT1 receptor 6ME2
TM2 154 2.55x55 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 155 2.56x551 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 156 2.57x56 M1 receptor 6OIJ Y1 receptor 5ZBH
TM2 157 2.58x57 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM2 158 2.59x58 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 159 2.60x59 M1 receptor 6OIJ OX1 receptor 6TO7
TM2 160 2.61x60 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 161 2.62x61 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM2 162 2.63x62 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 163 2.64x63 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 5XRA
TM2 164 2.65x64 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 165 2.66x65 M1 receptor 6OIJ MT1 receptor 6ME2
TM2 166 2.67x66 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM2 167 2.68x67 M1 receptor 6OIJ - -
ECL1 168 - - - - -
ECL1 169 - - - - -
ECL1 170 - - - - -
ECL1 171 - - - - -
ECL1 172 - - - - -
ECL1 173 - - - - -
ECL1 174 - - - - -
ECL1 175 - - - - -
ECL1 176 - - - - -
TM3 177 3.18x18 P2Y12 receptor 4PXZ - -
TM3 178 3.19x19 P2Y12 receptor 4PXZ - -
TM3 179 3.20x20 P2Y12 receptor 4PXZ - -
TM3 180 3.21x21 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 181 3.22x22 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM3 182 3.23x23 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 183 3.24x24 M1 receptor 6OIJ CCR7 6QZH
TM3 184 3.25x25 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 185 3.26x26 M1 receptor 6OIJ 5-HT2A receptor 6A94
TM3 186 3.27x27 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 187 3.28x28 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM3 188 3.29x29 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM3 189 3.30x30 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 190 3.31x31 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM3 191 3.32x32 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 192 3.33x33 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM3 193 3.34x34 M1 receptor 6OIJ PAR1 3VW7
TM3 194 3.35x35 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 195 3.36x36 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM3 196 3.37x37 M1 receptor 6OIJ MT1 receptor 6ME2
TM3 197 3.38x38 M1 receptor 6OIJ Y1 receptor 5ZBH
TM3 198 3.39x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 199 3.40x40 M1 receptor 6OIJ NOP receptor 5DHG
TM3 200 3.41x41 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 201 3.42x42 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM3 202 3.43x43 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6PWC
TM3 203 3.44x44 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 6PWC
TM3 204 3.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 205 3.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 206 3.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 207 3.48x48 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM3 208 3.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 209 3.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 210 3.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 211 3.52x52 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 212 3.53x53 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 213 3.54x54 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 214 3.55x55 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM3 215 3.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL2 216 - - - - -
ICL2 217 - Y1 receptor 5ZBH - -
ICL2 218 - Y1 receptor 5ZBH - -
ICL2 219 - Y1 receptor 5ZBH - -
ICL2 220 - Y1 receptor 5ZBH - -
ICL2 221 - - - - -
TM4 222 4.38x38 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM4 223 4.39x39 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 224 4.40x40 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 225 4.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 226 4.42x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 227 4.43x43 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM4 228 4.44x44 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 229 4.45x45 M1 receptor 6OIJ D4 receptor 5WIV
TM4 230 4.46x46 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM4 231 4.47x47 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 232 4.48x48 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 233 4.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 234 4.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 235 4.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 236 4.52x52 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 237 4.53x53 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM4 238 4.54x54 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM4 239 4.55x55 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 240 4.56x56 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM4 241 4.57x57 MT1 receptor 6ME2 5-HT1B receptor 6G79
TM4 242 4.58x59 MT1 receptor 6ME2 CB1 receptor 5XRA
TM4 243 4.59x60 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 244 4.60x61 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 245 4.61x62 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 246 4.62x63 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM4 247 4.63x64 M1 receptor 6OIJ LPA6 receptor 5XSZ
TM4 248 4.64x65 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
ECL2 249 - - - - -
ECL2 250 - OX2 receptor 4S0V - -
ECL2 251 - OX2 receptor 4S0V - -
ECL2 252 - OX2 receptor 4S0V - -
ECL2 253 - OX2 receptor 4S0V - -
ECL2 254 - OX2 receptor 4S0V - -
ECL2 255 - - - - -
ECL2 256 - - - - -
ECL2 257 - - - - -
ECL2 258 - - - - -
ECL2 259 - - - - -
ECL2 260 - OX2 receptor 4S0V - -
ECL2 261 - - - - -
ECL2 262 45.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 263 45.51x51 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
ECL2 264 45.52x52 M1 receptor 6OIJ DP2 receptor 6D27
ECL2 265 - - - - -
ECL2 266 - apelin receptor 5VBL - -
ECL2 267 - apelin receptor 5VBL apelin receptor 5VBL
ECL2 268 - apelin receptor 5VBL - -
ECL2 269 - apelin receptor 5VBL - -
ECL2 270 - apelin receptor 5VBL - -
ECL2 271 - apelin receptor 5VBL - -
ECL2 272 - apelin receptor 5VBL - -
ECL2 273 - - - - -
TM5 274 5.35x36 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 275 5.36x37 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM5 276 5.37x38 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 277 5.38x39 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 278 5.39x40 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM5 279 5.40x41 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 280 5.41x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 281 5.42x43 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM5 282 5.43x44 M1 receptor 6OIJ MT1 receptor 6ME2
TM5 283 5.44x45 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 284 5.45x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 285 5.46x461 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM5 286 5.47x47 M1 receptor 6OIJ Y1 receptor 5ZBH
TM5 287 5.48x48 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 288 5.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 289 5.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 290 5.51x51 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM5 291 5.52x52 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 292 5.53x53 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 293 5.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 294 5.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 295 5.56x56 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 296 5.57x57 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM5 297 5.58x58 M1 receptor 6OIJ DP2 receptor 6D27
TM5 298 5.59x59 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM5 299 5.60x60 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM5 300 5.61x61 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 301 5.62x62 M1 receptor 6OIJ EP4 receptor 5YWY
TM5 302 5.63x63 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM5 303 5.64x64 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM5 304 5.65x65 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM5 305 5.66x66 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 306 5.67x67 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 307 5.68x68 M1 receptor 6OIJ NK1 receptor 6HLP
TM5 308 5.69x69 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 309 5.70x70 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 310 5.71x71 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM5 311 5.72x72 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 312 5.73x73 M1 receptor 6OIJ - -
ICL3 313 - - - - -
ICL3 314 - - - - -
ICL3 315 - - - - -
ICL3 316 - - - - -
ICL3 317 - - - - -
TM6 318 6.22x22 A2A receptor 4UHR - -
TM6 319 6.23x23 A2A receptor 4UHR - -
TM6 320 6.24x24 A2A receptor 4UHR OX1 receptor 6TO7
TM6 321 6.25x25 A2A receptor 4UHR - -
TM6 322 6.26x26 A2A receptor 4UHR NTS1 receptor 5T04
TM6 323 6.27x27 A2A receptor 4UHR - -
TM6 324 6.28x28 A2A receptor 4UHR - -
TM6 325 6.29x29 A2A receptor 4UHR δ receptor 4N6H
TM6 326 6.30x30 A2A receptor 4UHR A2A receptor 4UHR
TM6 327 6.31x31 A2A receptor 4UHR A2A receptor 4UHR
TM6 328 6.32x32 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 329 6.33x33 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM6 330 6.34x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 331 6.35x35 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 332 6.36x36 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 333 6.37x37 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM6 334 6.38x38 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM6 335 6.39x39 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 336 6.40x40 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 5DYS
TM6 337 6.41x41 M1 receptor 6OIJ CXCR4 3ODU
TM6 338 6.42x42 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM6 339 6.43x43 M1 receptor 6OIJ AT1 receptor 6OS2
TM6 340 6.44x44 M1 receptor 6OIJ PAF receptor 5ZKQ
TM6 341 6.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 342 6.46x46 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 343 6.47x47 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM6 344 6.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 345 6.49x49 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM6 346 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 347 6.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 348 6.52x52 M1 receptor 6OIJ - -
TM6 349 6.53x53 M1 receptor 6OIJ MT1 receptor 6ME2
TM6 350 6.54x54 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 351 6.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 352 6.56x56 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 353 6.57x57 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM6 354 6.58x58 M1 receptor 6OIJ 5-HT2A receptor 6A94
TM6 355 6.59x59 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM6 356 6.60x60 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM6 357 6.61x61 M1 receptor 6OIJ TP receptor 6IIV
ECL3 358 - - - - -
ECL3 359 - - - - -
ECL3 360 - - - - -
ECL3 361 - - - - -
ECL3 362 - - - - -
ECL3 363 - - - - -
ECL3 364 - - - - -
TM7 365 7.31x30 MT1 receptor 6ME2 MT1 receptor 6ME2
TM7 366 7.32x31 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 367 7.33x32 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM7 368 7.34x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 369 7.35x34 M1 receptor 6OIJ GPR52 6LI1
TM7 370 7.36x35 M1 receptor 6OIJ MT1 receptor 6ME2
TM7 371 7.37x36 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM7 372 7.38x37 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 373 7.39x38 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM7 374 7.40x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 375 7.41x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 376 7.42x41 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 377 7.43x42 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 378 7.44x43 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM7 379 7.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 380 7.46x46 M1 receptor 6OIJ - -
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TM7 382 7.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 383 7.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 384 7.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 385 7.51x51 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
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G-PROTEIN TEMPLATES

Segment Seq.num. CGN# Backbone PDB Rotamer PDB
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