FPR3 - G(k) subunit alpha complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAI3

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 83%) PDB: 6OMM
G(i) subunit alpha-1 (sequence similarity: 98%)

RECEPTOR TEMPLATES

6LW5 (FPR2/ALX)
6OMM (FPR2/ALX)
3ODU (CXCR4)
4BUO (NTS1 receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 88.3 8.1 3.6
Side-chains 61.5 25.6 12.9

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 34

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 14 - FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
N-term 15 - FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
N-term 16 - FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
N-term 17 - FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
N-term 18 - FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
TM1 19 1.25x25 FPR2/ALX 6LW5 - -
TM1 20 1.26x26 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
TM1 21 1.27x27 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 22 1.28x28 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2A receptor 6A94
TM1 23 1.29x29 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 24 1.30x30 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 25 1.31x31 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 26 1.32x32 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 27 1.33x33 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 28 1.34x34 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM1 29 1.35x35 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2A receptor 6A94
TM1 30 1.36x36 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 31 1.37x37 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM1 32 1.38x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 33 1.39x39 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM1 34 1.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 35 1.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 36 1.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 37 1.43x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 38 1.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 39 1.45x45 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 40 1.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 41 1.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 42 1.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 43 1.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 44 1.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 45 1.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 46 1.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 47 1.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 48 1.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 49 1.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 50 1.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 51 1.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 52 1.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 53 1.59x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 54 1.60x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 55 1.61x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ICL1 56 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ICL1 57 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 58 2.37x37 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 59 2.38x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 60 2.39x39 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM2 61 2.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 62 2.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 63 2.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 64 2.43x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 65 2.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 66 2.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 67 2.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 68 2.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 69 2.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 70 2.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 71 2.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 72 2.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 73 2.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 74 2.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 75 2.54x54 FPR2/ALX 6OMM 5-HT1B receptor 6G79
TM2 76 2.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 77 2.56x56 FPR2/ALX 6OMM CB1 receptor 6N4B
TM2 78 2.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 79 2.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 80 2.59x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 81 2.60x60 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 82 2.61x61 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 83 2.62x62 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 84 2.63x63 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 85 2.64x64 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 86 2.65x65 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 87 2.66x66 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 88 2.67x67 FPR2/ALX 6OMM - -
ECL1 89 - - - - -
ECL1 90 23.49x49 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ECL1 91 23.50x50 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ECL1 92 23.51x51 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ECL1 93 23.52x52 - - - -
TM3 94 3.21x21 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 95 3.22x22 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 96 3.23x23 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 97 3.24x24 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 98 3.25x25 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 99 3.26x26 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 100 3.27x27 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 101 3.28x28 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM3 102 3.29x29 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 103 3.30x30 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3ODU
TM3 104 3.31x31 FPR2/ALX 6OMM CCR9 5LWE
TM3 105 3.32x32 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
TM3 106 3.33x33 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 107 3.34x34 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 108 3.35x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 109 3.36x36 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 110 3.37x37 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 111 3.38x38 FPR2/ALX 6OMM OX2 receptor 5WS3
TM3 112 3.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 113 3.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 114 3.41x41 FPR2/ALX 6OMM CysLT2 receptor 6RZ6
TM3 115 3.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 116 3.43x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 117 3.44x44 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 118 3.45x45 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM3 119 3.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 120 3.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 121 3.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 122 3.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 123 3.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 124 3.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 125 3.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 126 3.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 127 3.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 128 3.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 129 3.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ICL2 130 34.50x50 - - - -
ICL2 131 34.51x51 FPR2/ALX 6LW5 C5a1 receptor 5O9H
ICL2 132 34.52x52 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ICL2 133 34.53x53 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ICL2 134 34.54x54 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ICL2 135 34.55x55 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ICL2 136 34.56x56 FPR2/ALX 6LW5 FPR2/ALX 6LW5
ICL2 137 34.57x57 - - - -
TM4 138 4.38x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 139 4.39x39 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 140 4.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 141 4.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 142 4.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 143 4.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 144 4.44x44 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 145 4.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 146 4.46x46 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 147 4.47x47 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 148 4.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 149 4.49x49 FPR2/ALX 6OMM DP2 receptor 6D27
TM4 150 4.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 151 4.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 152 4.52x52 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM4 153 4.53x53 FPR2/ALX 6OMM MT1 receptor 6ME2
TM4 154 4.54x54 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM4 155 4.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 156 4.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 157 4.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 158 4.58x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 159 4.59x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 160 4.60x61 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM4 161 4.61x62 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 162 4.62x63 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 163 4.63x64 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 164 4.64x65 FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 165 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 166 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 167 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 168 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 169 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 170 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 171 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 172 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 173 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 174 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 175 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 176 45.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 177 45.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
ECL2 178 45.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 179 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 180 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 181 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 182 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 183 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 184 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 185 - FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 186 5.23x24 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 187 5.24x25 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 188 5.25x26 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 189 5.26x27 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 190 5.27x28 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 191 5.28x29 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 192 5.29x30 FPR2/ALX 6OMM CysLT1 receptor 6RZ4
TM5 193 5.30x31 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 194 5.31x32 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 195 5.32x33 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 196 5.33x34 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 197 5.34x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 198 5.35x36 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 199 5.36x37 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM5 200 5.37x38 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM5 201 5.38x39 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 202 5.39x40 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM5 203 5.40x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 204 5.41x42 FPR2/ALX 6OMM Y1 receptor 5ZBH
TM5 205 5.42x43 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3ODU
TM5 206 5.43x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 207 5.44x45 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM5 208 5.45x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 209 5.46x461 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 210 5.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 211 5.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 212 5.49x49 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 213 5.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 214 5.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 215 5.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 216 5.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 217 5.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 218 5.55x55 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM5 219 5.56x56 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM5 220 5.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 221 5.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 222 5.59x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 223 5.60x60 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3ODU
TM5 224 5.61x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 225 5.62x62 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 226 5.63x63 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 227 5.64x64 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 228 5.65x65 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 229 5.66x66 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 230 5.67x67 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 231 5.68x68 FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 232 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 233 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 234 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 235 - FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 236 6.30x30 CXCR4 3ODU C5a1 receptor 6C1R
TM6 237 6.31x31 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 238 6.32x32 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 239 6.33x33 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 240 6.34x34 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 241 6.35x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 242 6.36x36 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 243 6.37x37 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 244 6.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 245 6.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 246 6.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 247 6.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 248 6.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 249 6.43x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 250 6.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 251 6.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 252 6.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 253 6.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 254 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 255 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 256 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 257 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 258 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 259 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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ECL3 271 - NTS1 receptor 4BUO - -
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TM7 288 7.39x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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TM7 292 7.43x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 293 7.44x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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TM7 295 7.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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C-term 318 - - - - -
C-term 319 - - - - -
C-term 320 - - - - -
C-term 321 - - - - -
C-term 322 - - - - -

G-PROTEIN TEMPLATES

Segment Seq.num. CGN# Backbone PDB Rotamer PDB
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