AT2 receptor - G(z) subunit alpha complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAZ

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 44%) PDB: 6OMM
G(i) subunit alpha-1 (sequence similarity: 79%)

RECEPTOR TEMPLATES

6OMM (FPR2/ALX)
5UNF (AT2 receptor)
6JOD (AT2 receptor)
5UNG (AT2 receptor)
6OS2 (AT1 receptor)
5VBL (apelin receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 80.8 11.6 7.6
Side-chains 24.2 64.6 11.3

Number of backbone templates: 6
Number of rotamer templates: 10

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 40 - - - - -
N-term 41 - - - - -
N-term 42 - - - - -
N-term 43 - - - - -
N-term 44 - - - - -
TM1 45 1.33x33 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 5UNH
TM1 46 1.34x34 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 47 1.35x35 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 48 1.36x36 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 49 1.37x37 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 50 1.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 51 1.39x39 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 52 1.40x40 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 53 1.41x41 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 54 1.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 55 1.43x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 56 1.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 57 1.45x45 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 58 1.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 59 1.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 60 1.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 61 1.49x49 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 62 1.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 63 1.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 64 1.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 65 1.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 66 1.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 67 1.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 68 1.56x56 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 69 1.57x57 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 70 1.58x58 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 71 1.59x59 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 5UNG
TM1 72 1.60x60 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 5UNF
ICL1 73 - - - - -
ICL1 74 - AT2 receptor 5UNF AT2 receptor 5UNF
ICL1 75 - AT2 receptor 5UNF AT2 receptor 5UNF
ICL1 76 - AT2 receptor 5UNF AT2 receptor 5UNF
ICL1 77 - - - - -
TM2 78 2.38x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 79 2.39x39 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 80 2.40x40 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 81 2.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 82 2.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 83 2.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 84 2.44x44 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 85 2.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 86 2.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 87 2.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 88 2.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 89 2.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 90 2.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 91 2.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 92 2.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 93 2.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 94 2.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 95 2.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 96 2.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 97 2.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 98 2.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 99 2.59x59 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 100 2.60x60 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 101 2.61x61 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 102 2.62x62 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 103 2.63x63 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 104 2.64x64 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 105 2.65x65 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM2 106 2.66x66 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
ECL1 107 - - - - -
ECL1 108 - AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
ECL1 109 23.49x49 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
ECL1 110 23.50x50 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
ECL1 111 23.51x51 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
ECL1 112 23.52x52 - - - -
TM3 113 3.21x21 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 114 3.22x22 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 115 3.23x23 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 116 3.24x24 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 117 3.25x25 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 118 3.26x26 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 119 3.27x27 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 120 3.28x28 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 121 3.29x29 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 122 3.30x30 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 123 3.31x31 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 124 3.32x32 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 125 3.33x33 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 126 3.34x34 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 127 3.35x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 128 3.36x36 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 129 3.37x37 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 130 3.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 131 3.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 132 3.40x40 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 133 3.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 134 3.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 135 3.43x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 136 3.44x44 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 137 3.45x45 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 138 3.46x46 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 139 3.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 140 3.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 141 3.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 142 3.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 143 3.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 144 3.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 145 3.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 146 3.54x54 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 147 3.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 148 3.56x56 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
ICL2 149 34.50x50 - - - -
ICL2 150 34.51x51 AT1 receptor 6OS2 LPA6 receptor 5XSZ
ICL2 151 34.52x52 AT1 receptor 6OS2 BLT1 receptor 5X33
ICL2 152 34.53x53 AT1 receptor 6OS2 AT1 receptor 6OS2
ICL2 153 34.54x54 AT1 receptor 6OS2 FPR2/ALX 6LW5
ICL2 154 34.55x55 AT1 receptor 6OS2 Rhodopsin 4ZWJ
ICL2 155 34.56x56 - - - -
TM4 156 4.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 157 4.39x39 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 158 4.40x40 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 159 4.41x41 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 160 4.42x42 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 161 4.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 162 4.44x44 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 163 4.45x45 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 164 4.46x46 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 165 4.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 166 4.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 167 4.49x49 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 168 4.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 169 4.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 170 4.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 171 4.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 172 4.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 173 4.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 174 4.56x56 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 175 4.57x57 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 176 4.58x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 177 4.59x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 178 4.60x61 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 179 4.61x62 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 180 4.62x63 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 181 4.63x64 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 182 4.64x65 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
ECL2 183 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 184 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 185 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 186 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 187 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 188 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 189 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 190 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 191 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 192 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 193 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 194 - - - - -
ECL2 195 45.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 196 45.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
ECL2 197 45.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
ECL2 198 - - - - -
ECL2 199 - AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
ECL2 200 - AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
ECL2 201 - AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
ECL2 202 - - - - -
TM5 203 5.30x31 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 204 5.31x32 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 205 5.32x33 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 206 5.33x34 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 207 5.34x35 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 208 5.35x36 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 5UNG
TM5 209 5.36x37 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 210 5.37x38 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 211 5.38x39 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 212 5.39x40 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 213 5.40x41 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 214 5.41x42 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 215 5.42x43 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 216 5.43x44 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 217 5.44x45 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 218 5.45x46 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 219 5.46x461 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 220 5.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 221 5.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 222 5.49x49 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 223 5.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 224 5.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 225 5.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 226 5.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 227 5.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 228 5.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 229 5.56x56 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 230 5.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 231 5.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 232 5.59x59 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 233 5.60x60 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 234 5.61x61 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 235 5.62x62 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 236 5.63x63 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 237 5.64x64 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 238 5.65x65 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 239 5.66x66 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 240 5.67x67 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 241 5.68x68 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
ICL3 242 - - - - -
ICL3 243 - AT2 receptor 5UNG AT2 receptor 5UNG
ICL3 244 - - - - -
TM6 245 6.24x24 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM6 246 6.25x25 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM6 247 6.26x26 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM6 248 6.27x27 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM6 249 6.28x28 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM6 250 6.29x29 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM6 251 6.30x30 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM6 252 6.31x31 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 253 6.32x32 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 254 6.33x33 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 255 6.34x34 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 256 6.35x35 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 257 6.36x36 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 258 6.37x37 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 259 6.38x38 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 260 6.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 261 6.40x40 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 262 6.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 263 6.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 264 6.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 265 6.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 266 6.45x45 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 267 6.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 268 6.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 269 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 270 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 271 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 272 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 273 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 274 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 275 6.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 276 6.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 277 6.56x56 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 278 6.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 279 6.58x58 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 280 6.59x59 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 281 6.60x60 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 282 6.61x61 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM6 283 6.62x62 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM6 284 6.63x63 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM6 285 6.64x64 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
ECL3 286 - - - - -
ECL3 287 - AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
ECL3 288 - - - - -
TM7 289 7.24x23 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM7 290 7.25x24 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM7 291 7.26x25 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM7 292 7.27x26 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM7 293 7.28x27 AT2 receptor 6JOD AT2 receptor 6JOD
TM7 294 7.29x28 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM7 295 7.30x29 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM7 296 7.31x30 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM7 297 7.32x31 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
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TM7 299 7.34x33 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
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G-PROTEIN TEMPLATES

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