ACKR3 - G(i) subunit alpha-1 complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNAI1

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

FPR2/ALX (sequence similarity: 45%) PDB: 6OMM
G(i) subunit alpha-1 (sequence similarity: 100%)

RECEPTOR TEMPLATES

6OMM (FPR2/ALX)
4ZUD (AT1 receptor)
6QZH (CCR7)
6J21 (NK1 receptor)
3ODU (CXCR4)
5WB1 (US28)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 85.7 7.6 6.6
Side-chains 24.6 55.1 20.3

Number of backbone templates: 6
Number of rotamer templates: 52

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 36 - - - - -
N-term 37 - - - - -
N-term 38 - - - - -
N-term 39 - - - - -
N-term 40 - - - - -
TM1 41 1.29x29 FPR2/ALX 6OMM MT1 receptor 6ME3
TM1 42 1.30x30 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 43 1.31x31 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 44 1.32x32 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 45 1.33x33 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 46 1.34x34 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM1 47 1.35x35 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 48 1.36x36 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM1 49 1.37x37 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 50 1.38x38 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 5T04
TM1 51 1.39x39 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 52 1.40x40 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM1 53 1.41x41 FPR2/ALX 6OMM MT1 receptor 6ME2
TM1 54 1.42x42 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 55 1.43x43 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 56 1.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 57 1.45x45 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 58 1.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 59 1.47x47 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM1 60 1.48x48 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM1 61 1.49x49 FPR2/ALX 6OMM PAF receptor 5ZKQ
TM1 62 1.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 63 1.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 64 1.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM1 65 1.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 66 1.54x54 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM1 67 1.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 68 1.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM1 69 1.57x57 FPR2/ALX 6OMM - -
TM1 70 1.58x58 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM1 71 1.59x59 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM1 72 1.60x60 FPR2/ALX 6OMM TP receptor 6IIV
ICL1 73 12.48x48 - - - -
ICL1 74 12.49x49 AT1 receptor 4ZUD - -
ICL1 75 12.50x50 AT1 receptor 4ZUD - -
ICL1 76 12.51x51 - - - -
TM2 77 2.37x37 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM2 78 2.38x38 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 79 2.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 80 2.40x40 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM2 81 2.41x41 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM2 82 2.42x42 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 83 2.43x43 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 84 2.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 85 2.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 86 2.46x46 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 87 2.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 88 2.48x48 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM2 89 2.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 90 2.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 91 2.51x51 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 92 2.52x52 FPR2/ALX 6OMM - -
TM2 93 2.53x53 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM2 94 2.54x54 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 95 2.55x55 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM2 96 2.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 97 2.57x57 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM2 98 2.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 99 2.59x59 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM2 100 2.60x60 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 101 2.61x61 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 102 2.62x62 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 103 2.63x63 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM2 104 2.64x64 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM2 105 2.65x65 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM2 106 2.66x66 FPR2/ALX 6OMM C5a1 receptor 5O9H
ECL1 107 - - - - -
ECL1 108 - - - - -
ECL1 109 23.49x49 CCR7 6QZH CCR5 5UIW
ECL1 110 23.50x50 CCR7 6QZH CCR7 6QZH
ECL1 111 23.51x51 CCR7 6QZH AT1 receptor 6OS2
ECL1 112 23.52x52 - - - -
TM3 113 3.21x21 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 114 3.22x22 FPR2/ALX 6OMM δ receptor 4N6H
TM3 115 3.23x23 FPR2/ALX 6OMM M1 receptor 6OIJ
TM3 116 3.24x24 FPR2/ALX 6OMM A1 receptor 6D9H
TM3 117 3.25x25 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 118 3.26x26 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 119 3.27x27 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 120 3.28x28 FPR2/ALX 6OMM P2Y12 receptor 4NTJ
TM3 121 3.29x29 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 122 3.30x30 FPR2/ALX 6OMM EP3 receptor 6AK3
TM3 123 3.31x31 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 124 3.32x32 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 125 3.33x33 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 126 3.34x34 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 127 3.35x35 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 128 3.36x36 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 129 3.37x37 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 130 3.38x38 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 131 3.39x39 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 132 3.40x40 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 133 3.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 134 3.42x42 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 135 3.43x43 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 136 3.44x44 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 137 3.45x45 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 138 3.46x46 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM3 139 3.47x47 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 140 3.48x48 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM3 141 3.49x49 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 142 3.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM3 143 3.51x51 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 144 3.52x52 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM3 145 3.53x53 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM3 146 3.54x54 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM3 147 3.55x55 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM3 148 3.56x56 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
ICL2 149 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL2 150 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL2 151 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL2 152 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL2 153 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL2 154 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL2 155 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL2 156 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 157 4.38x38 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM4 158 4.39x39 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM4 159 4.40x40 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 160 4.41x41 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 161 4.42x42 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 162 4.43x43 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 163 4.44x44 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 164 4.45x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 165 4.46x46 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 166 4.47x47 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM4 167 4.48x48 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 168 4.49x49 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM4 169 4.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 170 4.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 171 4.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 172 4.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 173 4.54x54 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM4 174 4.55x55 FPR2/ALX 6OMM FFA1 receptor 5TZY
TM4 175 4.56x56 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM4 176 4.57x57 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM4 177 4.58x59 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 178 4.59x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM4 179 4.60x61 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3ODU
TM4 180 4.61x62 FPR2/ALX 6OMM - -
TM4 181 4.62x63 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM4 182 4.63x64 FPR2/ALX 6OMM CCR7 6QZH
TM4 183 4.64x65 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 184 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 185 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 186 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 187 - FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 188 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 189 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 190 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 191 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 192 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 193 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 194 - FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 195 - - - - -
ECL2 196 45.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
ECL2 197 45.51x51 FPR2/ALX 6OMM - -
ECL2 198 45.52x52 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
ECL2 199 - - - - -
ECL2 200 - NK1 receptor 6J21 NK1 receptor 6J21
ECL2 201 - NK1 receptor 6J21 - -
ECL2 202 - NK1 receptor 6J21 NK1 receptor 6J21
ECL2 203 - NK1 receptor 6J21 - -
ECL2 204 - NK1 receptor 6J21 - -
ECL2 205 - NK1 receptor 6J21 NK1 receptor 6J21
ECL2 206 - - - - -
TM5 207 5.33x34 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 208 5.34x35 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM5 209 5.35x36 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 210 5.36x37 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM5 211 5.37x38 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS0
TM5 212 5.38x39 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6VI4
TM5 213 5.39x40 FPR2/ALX 6OMM - -
TM5 214 5.40x41 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 215 5.41x42 FPR2/ALX 6OMM NTS1 receptor 6PWC
TM5 216 5.42x43 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 217 5.43x44 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM5 218 5.44x45 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 219 5.45x46 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 220 5.46x461 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 221 5.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 222 5.48x48 FPR2/ALX 6OMM CB2 receptor 6KPF
TM5 223 5.49x49 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 224 5.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 225 5.51x51 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 226 5.52x52 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 227 5.53x53 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 228 5.54x54 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM5 229 5.55x55 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 230 5.56x56 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM5 231 5.57x57 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM5 232 5.58x58 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 233 5.59x59 FPR2/ALX 6OMM AT2 receptor 6JOD
TM5 234 5.60x60 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 235 5.61x61 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM5 236 5.62x62 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 237 5.63x63 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM5 238 5.64x64 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM5 239 5.65x65 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM5 240 5.66x66 FPR2/ALX 6OMM CXCR4 3OE0
TM5 241 5.67x67 FPR2/ALX 6OMM BLT1 receptor 5X33
TM5 242 5.68x68 FPR2/ALX 6OMM NK1 receptor 6HLP
ICL3 243 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 244 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 245 - FPR2/ALX 6OMM - -
ICL3 246 - FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 247 6.30x30 CXCR4 3ODU CXCR4 3ODU
TM6 248 6.31x31 FPR2/ALX 6OMM β2-adrenoceptor 4LDE
TM6 249 6.32x32 FPR2/ALX 6OMM PAR1 3VW7
TM6 250 6.33x33 FPR2/ALX 6OMM MT2 receptor 6ME7
TM6 251 6.34x34 FPR2/ALX 6OMM - -
TM6 252 6.35x35 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 253 6.36x36 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 254 6.37x37 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM6 255 6.38x38 FPR2/ALX 6OMM CCR5 5UIW
TM6 256 6.39x39 FPR2/ALX 6OMM Y1 receptor 5ZBH
TM6 257 6.40x40 FPR2/ALX 6OMM Rhodopsin 4ZWJ
TM6 258 6.41x41 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 259 6.42x42 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 260 6.43x43 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 261 6.44x44 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 262 6.45x45 FPR2/ALX 6OMM 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 263 6.46x46 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM6 264 6.47x47 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 265 6.48x48 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 266 6.49x49 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 267 6.50x50 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 268 6.51x51 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 269 6.52x52 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 270 6.53x53 FPR2/ALX 6OMM LPA6 receptor 5XSZ
TM6 271 6.54x54 FPR2/ALX 6OMM ETB receptor 5X93
TM6 272 6.55x55 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
TM6 273 6.56x56 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 274 6.57x57 FPR2/ALX 6OMM FPR2/ALX 6OMM
TM6 275 6.58x58 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM6 276 6.59x59 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 277 6.60x60 FPR2/ALX 6OMM M2 receptor 4MQT
TM6 278 6.61x61 FPR2/ALX 6OMM succinate receptor 6RNK
TM6 279 6.62x62 CXCR4 3ODU PAR2 5NDD
TM6 280 6.63x63 CXCR4 3ODU CXCR4 3ODU
TM6 281 6.64x64 CXCR4 3ODU - -
ECL3 282 - - - - -
ECL3 283 - CXCR4 3ODU CXCR4 3ODU
ECL3 284 - CXCR4 3ODU - -
ECL3 285 - - - - -
TM7 286 7.24x23 CXCR4 3ODU NTS1 receptor 6PWC
TM7 287 7.25x24 CXCR4 3ODU CXCR4 3ODU
TM7 288 7.26x25 CXCR4 3ODU AT1 receptor 6DO1
TM7 289 7.27x26 CXCR4 3ODU NTS1 receptor 5T04
TM7 290 7.28x27 CXCR4 3ODU CXCR4 3ODU
TM7 291 7.29x28 FPR2/ALX 6OMM - -
TM7 292 7.30x29 FPR2/ALX 6OMM κ receptor 6B73
TM7 293 7.31x30 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM7 294 7.32x31 FPR2/ALX 6OMM P2Y12 receptor 4NTJ
TM7 295 7.33x32 FPR2/ALX 6OMM AT1 receptor 6OS2
TM7 296 7.34x33 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM7 297 7.35x34 FPR2/ALX 6OMM US28 5WB1
TM7 298 7.36x35 FPR2/ALX 6OMM μ receptor 5C1M
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G-PROTEIN TEMPLATES

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