A3 receptor - subunit alpha-11 complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNA11

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 45%) PDB: 6OIJ
subunit alpha-11 (sequence similarity: 100%)

RECEPTOR TEMPLATES

5UEN (A1 receptor)
6OIJ (M1 receptor)
5CXV (M1 receptor)
6PWC (NTS1 receptor)
4UHR (A2A receptor)
2YDV (A2A receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 75.2 17.1 7.7
Side-chains 22.6 54.8 22.6

Number of backbone templates: 6
Number of rotamer templates: 42

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 4 - - - - -
N-term 5 - - - - -
N-term 6 - - - - -
N-term 7 - - - - -
N-term 8 - - - - -
TM1 9 1.29x29 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
TM1 10 1.30x30 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM1 11 1.31x31 M1 receptor 6OIJ CCR5 5UIW
TM1 12 1.32x32 M1 receptor 6OIJ CysLT1 receptor 6RZ4
TM1 13 1.33x33 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM1 14 1.34x34 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM1 15 1.35x35 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 16 1.36x36 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 17 1.37x37 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 18 1.38x38 M1 receptor 6OIJ CCR7 6QZH
TM1 19 1.39x39 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 20 1.40x40 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM1 21 1.41x41 M1 receptor 6OIJ M3 receptor 5ZHP
TM1 22 1.42x42 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 23 1.43x43 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM1 24 1.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 25 1.45x45 M1 receptor 6OIJ - -
TM1 26 1.46x46 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 27 1.47x47 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 28 1.48x48 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM1 29 1.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 30 1.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 31 1.51x51 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 32 1.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 33 1.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 34 1.54x54 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 35 1.55x55 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM1 36 1.56x56 M1 receptor 6OIJ CB1 receptor 6N4B
TM1 37 1.57x57 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 38 1.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM1 39 1.59x59 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM1 40 1.60x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ICL1 41 12.48x48 - - - -
ICL1 42 12.49x49 A1 receptor 5UEN CB1 receptor 5TGZ
ICL1 43 12.50x50 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ICL1 44 12.51x51 - - - -
TM2 45 2.37x37 A1 receptor 5UEN M2 receptor 4MQT
TM2 46 2.38x38 A1 receptor 5UEN NTS1 receptor 6PWC
TM2 47 2.39x39 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 48 2.40x40 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 49 2.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 50 2.42x42 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 51 2.43x43 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 52 2.44x44 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 53 2.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 54 2.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 55 2.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 56 2.48x48 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM2 57 2.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 58 2.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 59 2.51x51 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM2 60 2.52x52 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 61 2.53x53 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 62 2.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 63 2.55x55 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM2 64 2.56x551 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 65 2.57x56 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 66 2.58x57 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 67 2.59x58 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 68 2.60x59 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 69 2.61x60 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 70 2.62x61 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM2 71 2.63x62 M1 receptor 6OIJ μ receptor 5C1M
TM2 72 2.64x63 M1 receptor 6OIJ κ receptor 6B73
TM2 73 2.65x64 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM2 74 2.66x65 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM2 75 2.67x66 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
ECL1 76 23.50x50 - - - -
ECL1 77 23.51x51 A1 receptor 5UEN β2-adrenoceptor 4LDL
ECL1 78 23.52x52 - - - -
TM3 79 3.21x21 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 80 3.22x22 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 81 3.23x23 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM3 82 3.24x24 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 83 3.25x25 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 84 3.26x26 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 85 3.27x27 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 86 3.28x28 M1 receptor 6OIJ CysLT2 receptor 6RZ6
TM3 87 3.29x29 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM3 88 3.30x30 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 89 3.31x31 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 90 3.32x32 M1 receptor 6OIJ succinate receptor 6RNK
TM3 91 3.33x33 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 92 3.34x34 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 93 3.35x35 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM3 94 3.36x36 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 95 3.37x37 M1 receptor 6OIJ - -
TM3 96 3.38x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 97 3.39x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 98 3.40x40 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 99 3.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 100 3.42x42 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM3 101 3.43x43 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 102 3.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 103 3.45x45 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 104 3.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 105 3.47x47 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 106 3.48x48 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 107 3.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 108 3.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 109 3.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 110 3.52x52 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 111 3.53x53 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 112 3.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM3 113 3.55x55 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM3 114 3.56x56 M1 receptor 6OIJ - -
ICL2 115 34.50x50 - - - -
ICL2 116 34.51x51 A1 receptor 5UEN 5-HT1B receptor 6G79
ICL2 117 34.52x52 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ICL2 118 34.53x53 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ICL2 119 34.54x54 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ICL2 120 34.55x55 A1 receptor 5UEN CB1 receptor 5XRA
ICL2 121 34.56x56 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ICL2 122 34.57x57 - - - -
TM4 123 4.38x38 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 124 4.39x39 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 125 4.40x40 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 126 4.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 127 4.42x42 M1 receptor 6OIJ - -
TM4 128 4.43x43 M1 receptor 6OIJ C5a1 receptor 5O9H
TM4 129 4.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 130 4.45x45 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 131 4.46x46 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM4 132 4.47x47 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 133 4.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 134 4.49x49 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 135 4.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 136 4.51x51 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 137 4.52x52 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 138 4.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 139 4.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM4 140 4.55x55 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM4 141 4.56x56 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 142 4.57x57 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 143 4.58x58 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 144 4.59x59 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 145 4.60x60 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 146 4.61x61 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 147 4.62x62 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM4 148 4.63x63 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
ECL2 149 - - - - -
ECL2 150 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 151 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 152 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 153 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 154 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 155 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 156 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 157 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 158 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 159 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 160 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 161 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 162 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 163 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 164 - NTS1 receptor 6PWC - -
ECL2 165 - - - - -
ECL2 166 45.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL2 167 45.51x51 M1 receptor 6OIJ M5 receptor 6OL9
ECL2 168 45.52x52 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 4LDE
ECL2 169 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 170 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 171 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 172 - M1 receptor 6OIJ - -
TM5 173 5.34x36 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 174 5.35x37 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 175 5.36x38 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 176 5.37x39 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 177 5.38x40 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 178 5.39x41 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
TM5 179 5.40x411 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
TM5 180 5.41x42 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
TM5 181 5.42x43 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 182 5.43x44 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 183 5.44x45 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 184 5.45x46 M1 receptor 6OIJ BLT1 receptor 5X33
TM5 185 5.46x461 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 186 5.47x47 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM5 187 5.48x48 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 188 5.49x49 M1 receptor 6OIJ 5-HT2C receptor 6BQG
TM5 189 5.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 190 5.51x51 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 191 5.52x52 M1 receptor 6OIJ β2-adrenoceptor 3SN6
TM5 192 5.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 193 5.54x54 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 194 5.55x55 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 195 5.56x56 M1 receptor 6OIJ 5-HT1B receptor 6G79
TM5 196 5.57x57 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 197 5.58x58 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 198 5.59x59 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 199 5.60x60 M1 receptor 6OIJ BLT1 receptor 5X33
TM5 200 5.61x61 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 201 5.62x62 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 202 5.63x63 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 203 5.64x64 M1 receptor 6OIJ US28 5WB1
TM5 204 5.65x65 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 205 5.66x66 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 206 5.67x67 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM5 207 5.68x68 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM5 208 5.69x69 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 209 5.70x70 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 210 5.71x71 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 211 5.72x72 M1 receptor 6OIJ - -
TM5 212 5.73x73 M1 receptor 6OIJ - -
ICL3 213 - - - - -
ICL3 214 - - - - -
ICL3 215 - - - - -
ICL3 216 - - - - -
TM6 217 6.22x22 A2A receptor 4UHR - -
TM6 218 6.23x23 A2A receptor 4UHR - -
TM6 219 6.24x24 A2A receptor 4UHR AT2 receptor 6JOD
TM6 220 6.25x25 A2A receptor 4UHR - -
TM6 221 6.26x26 A2A receptor 4UHR - -
TM6 222 6.27x27 A2A receptor 4UHR A1 receptor 6D9H
TM6 223 6.28x28 A2A receptor 4UHR A1 receptor 6D9H
TM6 224 6.29x29 A2A receptor 4UHR 5-HT1B receptor 6G79
TM6 225 6.30x30 A2A receptor 4UHR A2A receptor 4UHR
TM6 226 6.31x31 A2A receptor 4UHR MT1 receptor 6PS8
TM6 227 6.32x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 228 6.33x33 M1 receptor 6OIJ EP3 receptor 6AK3
TM6 229 6.34x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 230 6.35x35 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 231 6.36x36 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 232 6.37x37 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 233 6.38x38 M1 receptor 6OIJ M4 receptor 6KP6
TM6 234 6.39x39 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 235 6.40x40 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM6 236 6.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 237 6.42x42 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 238 6.43x43 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 239 6.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 240 6.45x45 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 241 6.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 242 6.47x47 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 243 6.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 244 6.49x49 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 245 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 246 6.51x51 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 247 6.52x52 M1 receptor 6OIJ OX2 receptor 5WS3
TM6 248 6.53x53 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 249 6.54x54 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM6 250 6.55x55 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 251 6.56x56 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 252 6.57x57 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 253 6.58x58 M1 receptor 6OIJ Rhodopsin 4ZWJ
TM6 254 6.59x59 M1 receptor 6OIJ NK1 receptor 6HLP
TM6 255 6.60x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 256 6.61x61 M1 receptor 6OIJ MT2 receptor 6ME6
ECL3 257 - - - - -
ECL3 258 - M1 receptor 5CXV - -
ECL3 259 - M1 receptor 5CXV - -
ECL3 260 - - - - -
TM7 261 7.32x31 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM7 262 7.33x32 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM7 263 7.34x33 M1 receptor 6OIJ M2 receptor 4MQT
TM7 264 7.35x34 M1 receptor 6OIJ 5-HT2B receptor 5TUD
TM7 265 7.36x35 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 266 7.37x36 M1 receptor 6OIJ - -
TM7 267 7.38x37 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 268 7.39x38 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 269 7.40x39 M1 receptor 6OIJ AT2 receptor 6JOD
TM7 270 7.41x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 271 7.42x41 M1 receptor 6OIJ A2A receptor 5G53
TM7 272 7.43x42 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 273 7.44x43 M1 receptor 6OIJ NTS1 receptor 5T04
TM7 274 7.45x45 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 275 7.46x46 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 276 7.47x47 M1 receptor 6OIJ CB2 receptor 6KPF
TM7 277 7.48x48 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 278 7.49x49 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 279 7.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM7 281 7.52x52 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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G-PROTEIN TEMPLATES

Segment Seq.num. CGN# Backbone PDB Rotamer PDB
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