A1 receptor - subunit alpha-14 complex homology model

RECEPTOR CLASS

Class A (Rhodopsin)

RECEPTOR

SPECIES

Homo sapiens

G-PROTEIN CLASS

GNA14

G-PROTEIN

VERSION

2020-06-21

MODEL

PDB file contains GPCRdb generic numbers in the B-factor field of CA atoms

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MAIN TEMPLATE

M1 receptor (sequence similarity: 43%) PDB: 6OIJ
subunit alpha-11 (sequence similarity: 91%)

RECEPTOR TEMPLATES

5UEN (A1 receptor)
6OIJ (M1 receptor)
4UHR (A2A receptor)
2YDV (A2A receptor)
3SN6 (β2-adrenoceptor)
None
Main template (%) Additional templates (%) No template - freely modelled (%)
Backbone 73.0 19.1 7.8
Side-chains 20.4 67.7 11.9

Number of backbone templates: 4
Number of rotamer templates: 10

Segment Seq.num. GPCRdb# Backbone PDB Rotamer PDB
N-term 1 - - - - -
N-term 2 - - - - -
N-term 3 - - - - -
N-term 4 - - - - -
N-term 5 - - - - -
TM1 6 1.29x29 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
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TM1 14 1.37x37 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 15 1.38x38 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM1 16 1.39x39 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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TM2 70 2.65x64 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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ICL2 118 34.56x56 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ICL2 119 34.57x57 - - - -
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TM4 121 4.39x39 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ECL2 146 - - - - -
ECL2 147 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 148 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 149 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 150 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 151 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 152 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 153 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 154 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 155 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 156 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 157 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 158 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 159 - A1 receptor 5UEN - -
ECL2 160 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 161 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 162 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 163 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 164 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 165 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 166 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 167 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL2 168 - - - - -
ECL2 169 45.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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ECL2 172 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 173 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 174 - M1 receptor 6OIJ - -
ECL2 175 - M1 receptor 6OIJ - -
TM5 176 5.34x36 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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TM5 184 5.42x43 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 185 5.43x44 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 186 5.44x45 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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TM5 188 5.46x461 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 189 5.47x47 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 190 5.48x48 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 191 5.49x49 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 192 5.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM5 195 5.53x53 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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TM5 197 5.55x55 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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TM5 202 5.60x60 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 203 5.61x61 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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TM5 207 5.65x65 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 208 5.66x66 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 209 5.67x67 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 210 5.68x68 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 211 5.69x69 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM5 212 5.70x70 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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ICL3 216 - - - - -
ICL3 217 - - - - -
ICL3 218 - - - - -
ICL3 219 - - - - -
ICL3 220 - - - - -
TM6 221 6.22x22 A2A receptor 4UHR - -
TM6 222 6.23x23 A2A receptor 4UHR - -
TM6 223 6.24x24 A2A receptor 4UHR A1 receptor 6D9H
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TM6 230 6.31x31 A2A receptor 4UHR A1 receptor 6D9H
TM6 231 6.32x32 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM6 233 6.34x34 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM6 235 6.36x36 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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TM6 238 6.39x39 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 239 6.40x40 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 240 6.41x41 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM6 242 6.43x43 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 243 6.44x44 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 244 6.45x45 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 245 6.46x46 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 246 6.47x47 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 247 6.48x48 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 248 6.49x49 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM6 249 6.50x50 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
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TM6 251 6.52x52 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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TM6 259 6.60x60 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM6 260 6.61x61 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
ECL3 261 - - - - -
ECL3 262 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL3 263 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL3 264 - A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
ECL3 265 - - - - -
TM7 266 7.31x30 A1 receptor 5UEN A1 receptor 5UEN
TM7 267 7.32x31 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 268 7.33x32 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 269 7.34x33 M1 receptor 6OIJ M1 receptor 6OIJ
TM7 270 7.35x34 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 271 7.36x35 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 272 7.37x36 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 273 7.38x37 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 274 7.39x38 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
TM7 275 7.40x39 M1 receptor 6OIJ A1 receptor 6D9H
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G-PROTEIN TEMPLATES

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